دانلود مقالات ISI درباره شبیه سازی پویایی مولکولی + ترجمه فارسی

MD simulations of the central pore of ryanodine receptors and sequence comparison with 2B protein from coxsackie virus

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Ryanodine receptor; Ca homeostasis; Molecular dynamics simulations; Ion dynamics; Viral channel proteins; 2B of coxsackie virus;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 10 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Effects of protein flexibility on the site of metabolism prediction for CYP2A6 substrates

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; CYP2A6; Site of metabolism; Flexibility; Molecular dynamics simulations; Molecular docking;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 10 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Ti and N adatom descent pathways to the terrace from atop two-dimensional TiN/TiN(001) islands

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Nitrides; Titanium alloy; Nucleation; Growth; Diffusion; Molecular dynamics simulations

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 10 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Mutagenesis and molecular dynamics simulations revealed the chitooligosaccharide entry and exit points for chitinase D from Serratia proteamaculans

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Chitinases; Chitooligosaccharides; SpChiD; Transglycosylation; Mutagenesis; Molecular Dynamics Simulations

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 10 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

MDMC2: A molecular dynamics code for investigating the fragmentation dynamics of multiply charged clusters

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Molecular dynamics simulations; Mesoscopic coarse-grained models; Charged clusters and droplets; Electrospray ionisation; Evaporation; Fission

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 11 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Competition between dislocations and cracks in molecular dynamics simulations of metal nanoimprinting

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Nanoimprinting; Crack; Dislocations; Thermal fluctuations; Molecular dynamics simulations;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 11 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Structure evolution and reaction mechanism in the Ni/Al reactive multilayer nanofoils

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Ni–Al; Combustion; Multilayer thin films; Molecular dynamics simulations; Reaction mechanism

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 11 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Two homologous neutrophil serine proteases bind to POPC vesicles with different affinities: When aromatic amino acids matter

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; PR3; proteinase 3; HNE; human neutrophil elastase; LUV; large unilamellar vesicle; POPC; 1-palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine; SPR; surface plasmon resonance; MD; molecular dynamics; Amphitropic protein; Large unilamellar vesicles; Molecular d

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 12 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Stability and amorphization of Cu–Nb interfaces during severe plastic deformation: Molecular dynamics simulations of simple shear

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Metal matrix composites; Severe plastic deformation; Amorphous alloy; Interface; Molecular dynamics simulations

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 12 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Structural and energetic analysis to provide insight residues of CYP2C9, 2C11 and 2E1 involved in valproic acid dehydrogenation selectivity

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Drug metabolism; CYP450 enzymes; Molecular dynamics simulations; Molecular mechanics generalized born surface area; CYP; cytochrome P-450; CYP2C9; cytochrome P-450 C9; CYP2C11; cytochrome P-450 C11; CYP2E1; cytochrome P-450 E1; MD; molecular dynamics; MM-

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 14 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Shedding light on the self-assembly of stable SiC based cage nanostructures: A comprehensive molecular dynamics study

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; SiC caged structures; Molecular dynamics simulations; Self-assembly; Composition; Bonding nature; Stability; Electronic properties;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 14 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Interactions of amikacin with the RNA model of the ribosomal A-site: Computational, spectroscopic and calorimetric studies

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Ribosomal RNA A-site; Amikacin; Molecular dynamics simulations; Melting temperatures; Isothermal titration calorimetry;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 15 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Molecular modeling studies of atorvastatin analogues as HMGR inhibitors using 3D-QSAR, molecular docking and molecular dynamics simulations

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; HMGR; Statins; 3D-QSAR; gem-Difluoro; Molecular dynamics simulations;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 16 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Detailed analysis and follow-up studies of a high-throughput screening for indoleamine 2,3-dioxygenase 1 (IDO1) inhibitors

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Cancer immunotherapy; Enzyme inhibition; High throughput screening; Indoleamine 2,3-dioxygenase; In silico drug design; Molecular dynamics simulations; Structure–activity relationship; Tryptophan metabolismIDO1, indoleamine 2,3-dioxygenase 1; MHC, Maybrid

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 18 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Structural characterization of inclusion complexes between cyanidin-3-O-glucoside and β-cyclodextrin

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Anthocyanins; β-Cyclodextrin; DOSY; Molecular Dynamics simulations; NMR; ROESY;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 39 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

The complex folding behavior of HIV-1-protease monomer revealed by optical-tweezer single-molecule experiments and molecular dynamics simulations

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; HIV-1-protease; Single-molecule studies; Protein folding; Intermediate states; Molecular dynamics simulations;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 40 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Atomistic simulations of MeV ion irradiation of silica

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Radiation damage; Molecular dynamics simulations; Inelastic thermal spike;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 4 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Molecular dynamics simulations of the failure behaviors of closed carbon nanotubes fully filled with C60 fullerenes

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Carbon nanotubes; Nanopeapods; Mechanical properties; Molecular dynamics simulations;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

A molecular dynamics study of the Si-nanowire@carbon-nanotube nanocomposite with sp3 interfacial bonding

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Carbon nanotube; Si nanowires; Mechanical properties; Molecular dynamics simulations;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Effect of melatonin and cholesterol on the structure of DOPC and DPPC membranes

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Lipid membrane; Cholesterol; Melatonin; Small-angle neutron diffraction (SAND); Small-angle neutron scattering (SANS); Molecular Dynamics simulations;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 8 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Low concentrated hydroxyectoine solutions in presence of DPPC lipid bilayers: A computer simulation study

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Compatible solutes; Osmolytes; Molecular Dynamics simulations; DPPC lipid bilayers; Kosmotropes;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 8 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Interpretation of 1H and 2H spin-lattice relaxation dispersions: Insights from molecular dynamics simulations of polymer melts

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Spin-lattice relaxation dispersion; Field-cycling relaxometry; Polymer dynamics; Molecular dynamics simulations;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Insights into susceptibility of antiviral drugs against the E119G mutant of 2009 influenza A (H1N1) neuraminidase by molecular dynamics simulations and free energy calculations

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Influenza viruses; H1N1; Neuraminidase inhibitors; Drug resistance; Molecular dynamics simulations; MM/GBSA;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Protonation of trimethylamine N-oxide (TMAO) is required for stabilization of RNA tertiary structure

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; PreQ1 riboswitch; RNA folding; pKa; RNA tertiary structure; Constant pH simulations; Molecular dynamics simulations;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Modeling, docking and dynamics simulations of a non-specific lipid transfer protein from Peganum harmala L.

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Ala; alanine; C; carbon; Cys; cysteine; Glu; glutamic acid; Leu; leucine; MD; molecular dynamics; MEGA; Molecular Evolutionary Genetics Analysis; NMR; nuclear magnetic resonance; nsLTP; non-specific lipid transfer protein; PHL-nsLTP; Peganum harmala L. no

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 10 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

The cost of living in the membrane: A case study of hydrophobic mismatch for the multi-segment protein LeuT

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Lipid-protein interactions; Hydrophobic mismatch; Residual exposure energy; Leucine transporter; Neurotransmitter:sodium symporters; Multi-segment transmembrane proteins; Molecular dynamics simulations; Membrane deformation energy;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 12 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Membrane thickness and the mechanism of action of the short peptaibol trichogin GA IV

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; HFIP; 1,1,1,3,3,3-hexafluoroisopropanol; Aib; α-aminoisobutyric acid; Alm; alamethicin; AMP; antimicrobial peptide; CF; carboxyfluorescein; DIEA; N,N-diisopropylethylamine; DMF; N,N-dimethylformamide; EDC; N-ethyl, N′-[3-(dimethylamino)propyl]carbodiim

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 12 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Frataxin from Psychromonas ingrahamii as a model to study stability modulation within the CyaY protein family

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Protein flexibility; Protein stability; Protein dynamics; Stability modulation; Crystallography; Molecular dynamics simulations;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 13 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Structural features of the apelin receptor N-terminal tail and first transmembrane segment implicated in ligand binding and receptor trafficking

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; AR; apelin receptor; AR55; residues 1-55 of AR; BSA; bovine serum albumin; CSI; chemical shift index; DMEM; Dulbecco's modified eagle medium; DPC; dodecylphosphocholine; DPPC; dipalmitoylphosphatidylcholine; DSS; sodium 2,2-dimethyl-2-silapentane-5-sulf

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 13 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Molecular dynamics simulations of isoleucine-release pathway in GAF domain of N-CodY from Bacillus Subtilis

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; GAF domain; N-CodY; Bacillus subtilis; Molecular dynamics simulations; Force probe molecular dynamics;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 31 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Self-diffusion coefficients of methane/n-hexane mixtures at high pressures: An evaluation of the finite-size effect and a comparison of force fields

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Self-diffusion; Molecular dynamics simulations; N-alkanes; Force fields;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2020 سفارش ترجمه

As good as it gets? Folding molecular dynamics simulations of the LytA choline-binding peptide result to an exceptionally accurate model of the peptide structure

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Molecular dynamics simulations; Peptide folding; Choline binding repeat; LytA protein; Empirical force fields; AMBER force field

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 4 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Molecular dynamics simulation of damage cascade creation in SiC composites containing SiC/graphite interface

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Molecular dynamics simulations; SiC composite; Interface; Damage cascade

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 5 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Ag adatom and dimer motion on Cu(1 1 0)(1 × 2) missing row surface

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Embedded adatom method; Molecular dynamics simulations; Diffusion; Small cluster; Copper; Silver;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 5 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Kinetic sonication effects in aqueous acetonitrile solutions. Reaction rate levelling by ultrasound

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Kinetic sonication effects; Molecular dynamics simulations; Organic aqueous solutions; Preferential solvation; Ultrasound

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 5 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Structure-based computational study of the hydrolysis of New Delhi metallo-β-lactmase-1

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; New Delhi metallo-β-lactmase-1; Metallo-β-lactamase; Molecular dynamics simulations; Molecular mechanics/Poisson–Boltzmann surface area

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Investigation on the most probable breaking behaviors of copper nanowires with the dependence of temperature

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Molecular dynamics simulations; Copper nanowires; The most probable breaking position

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Continuum and molecular dynamics study of C60 fullerene–carbon nanotube oscillators

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; C60 fullerene; Carbon nanotube; Continuum approximation; Molecular dynamics simulations; Oscillation frequency

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Competing forces in the interaction of polyelectrolytes with charged interfaces

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Polyelectrolytes; Adsorption; Charge reversal; Like-charge attraction; Molecular dynamics simulations; Monte Carlo simulations; Hydrogen bonding; Hydrophobic effect

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Theoretical study of soft-to-hard transition of copper-filled carbon nanotubes

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Copper-filled carbon nanotubes; Molecular dynamics simulations; Soft-to-hard transition; High radial strength

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Propofol modulates the lipid phase transition and localizes near the headgroup of membranes

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Propofol; Anesthesia; Lipid bilayer; Langmuir monolayer; Calorimetry; Molecular dynamics simulations

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 8 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Terahertz microfluidic sensor for in situ exploration of hydration shell of molecules

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; MCR-ALS; Lab-on-chip; Terahertz spectroscopy; Hydration shell; Molecular dynamics simulations

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 8 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

In silico investigations of anti-androgen activity of polychlorinated biphenyls

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Polychlorinated biphenyls; Androgen receptor; 3D-QSAR; Molecular docking; Molecular dynamics simulations

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 8 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Single-edge crack growth in graphene sheets under tension

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Fracture; Graphene sheet; Molecular dynamics simulations

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 8 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Three complementary techniques for the clarification of temperature effect on low-density lipoprotein–chondroitin-6-sulfate interaction

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Quartz crystal microbalance; Partial filling affinity capillary electrophoresis; Molecular dynamics simulations; Adsorption energy distribution; Low-density lipoprotein; Glycosaminoglycan

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Enhanced and correlated lattice vibrations of relaxed Cu(0 0 1) surface studied by high-resolution medium energy ion scattering

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Enhanced and correlated lattice vibrations; Medium energy ion scattering; Relaxed Cu(0 0 1) surface; Molecular dynamics simulations; Monte Carlo simulations

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Computer modeling on the tautomerization of sulbactam intermediate in SHV-1 β-lactamases: E166A mutant vs. wild type

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Molecular dynamics simulations; Density functional theory; Tautomerization; Proton transfer; β-Lactamases

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

The importance of lattice flexibility for the migration of ethane in ZIF-8: Molecular dynamics simulations

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Molecular dynamics simulations; Ethane ZIF-8; Lattice flexibility; Diffusion

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Influence of solvation on the structural and capacitive properties of electrical double layer capacitors

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Double layer capacitance; Solvation; Molecular dynamics simulations; Interfacial structure; Graphite

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 10 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Communication between the active site and the allosteric site in class A beta-lactamases

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; BLIP, beta-lactamase inhibitor protein; MD, molecular dynamics; MSF, mean square fluctuations; RMSD, root mean square deviation; VMD, visual molecular dynamicsBeta-lactamase; Ligand binding; Molecular dynamics simulations; Binding free energy; Allostery

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 10 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه