دانلود مقالات ISI درباره شبیه سازی پویایی مولکولی + ترجمه فارسی

Molecular dynamics simulations of G-DNA and perspectives on the simulation of nucleic acid structures

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Molecular dynamics simulations; Guanine quadruplex; DNA ligand binding; Force field limitations; Force field development;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 15 صفحه سال انتشار : 2012 سفارش ترجمه

Size effect on mechanical properties of carbon nanotube X-junctions

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Carbon nanotube X-junctions; Mechanical properties; Size effects; Molecular dynamics simulations

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 4 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

A statistical analysis of the lateral displacement of Si atoms in molecular dynamics simulations of successive bombardment with 20-keV C60 projectiles

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; ToF-SIMS; Sputter depth profiling; Sputtering; Molecular dynamics simulations; Cluster ions; C60+; Si;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 4 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

The missing link between the Hydration Force and interfacial water: Evidence from computer simulations

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Molecular dynamics simulations; Hydration force; Interfacial water; Nonlocal dielectric response

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 4 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

Potential of mean force for separation of the repeating units in cellulose and hemicellulose

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Cellobiose; Xylobiose; Disaccharides; Potential of mean force; Umbrella sampling; Molecular dynamics simulations;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 5 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

Wave packet evolution of the valence state of a hyperthermal sodium ion impinging on a copper surface

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Impact phenomena (including electron spectra and sputtering); Theories and models of many-electron systems; Electron states at surfaces and interfaces; Molecular dynamics simulations

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 5 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

Investigating the temperature dependence of elastic constants by thermal fluctuation formula

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Thermal fluctuation formula; Mechanical properties; Molecular dynamics simulations

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 5 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

Effects of deformability and thermal motion of lipid membrane on electroporation: By molecular dynamics simulations

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Membrane electroporation; Molecular dynamics simulations; Mechanical property; Thermal motion

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 5 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

Ion transport pathways in molecular dynamics simulated alkali silicate glassy electrolytes

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Silicate glasses; Ionic conductivity; Molecular dynamics simulations; Bond valence approach

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 5 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

HBonanza: A computer algorithm for molecular-dynamics-trajectory hydrogen-bond analysis

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Hydrogen bond; Computational chemistry; Molecular dynamics simulations; Molecular recognition; Computer-aided drug design

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 5 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

Molecular dynamics simulations of adsorption of hydrophobic 1,2,4-trichlorobenzene (TCB) on hydrophilic TiO2 in surfactant emulsions and experimental process efficiencies of photo-degradation and -dechlorination

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Molecular dynamics simulations; Modeling adsorption; Photodegradation; Photodechlorination; Titanium dioxide dispersions; Hydrophilic biosurfactant; Hydrophobic SDS surfactant; 1,2,4-Trichlorobenzene

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

Water transport in human aquaporin-4: Molecular dynamics (MD) simulations

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; MD; molecular dynamics; SMD; steered MD; PDB; protein data bank; RMSD; root mean-squared deviation; POPC; palmitoyl-oleoyl-phosphatidyl-choline; PSF; protein structure file; NPA; Asn-Pro-Ala; PME; Particle Mesh Ewald; BD-FDT; brownian dynamics fluctuation

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

Molecular dynamics simulations and MM/GBSA methods to investigate binding mechanisms of aminomethylpyrimidine inhibitors with DPP-IV

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Molecular dynamics simulations; MM/GBSA; Aminomethylpyrimidine inhibitors; DPP-IV

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

Molecular dynamics study of the conformational stability of esterase 2 from Alicyclobacillus acidocaldarius

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Thermophilic esterase; Conformational stability; Cooperative and coupled domains; Molecular dynamics simulations;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

Effects of Ca2+ on supramolecular aggregation of natural organic matter in aqueous solutions: A comparison of molecular modeling approaches

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Natural organic matter; Supramolecular aggregation; Molecular dynamics simulations

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

Active-site residues move independently from the rest of the protein in a 200 ns molecular dynamics simulation of cytochrome P450 CYP119

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Molecular dynamics simulations; Mutual information; Cytochrome P450; CYP119; Protein dynamics

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

How do carbon nanotubes serve as carriers for gemcitabine transport in a drug delivery system?

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Carbon nanotube; Gemcitabine; Drug delivery; Molecular dynamics simulations; Steered molecular dynamics simulations

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

Secondary Johari–Goldstein relaxation in linear polymer melts represented by a simple bead-necklace model

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Polymer dynamics; Secondary relaxation; Molecular dynamics simulations

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

Conjugated double bonds in lipid bilayers: A molecular dynamics simulation study

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Conjugated linoleic acids; Molecular dynamics simulations

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

Novel cytotoxity exhibition mode of polybia-CP, a novel antimicrobial peptide from the venom of the social wasp Polybia paulista

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Antimicrobial peptide; Polybia-CP; Molecular dynamics simulations; Membrane perturbation; “Carpet” model;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

Molecular dynamics simulations of inverse sodium dodecyl sulfate (SDS) micelles in a mixed toluene/pentanol solvent in the absence and presence of poly(diallyldimethylammonium chloride) (PDADMAC)

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Surfactant micelles; Molecular dynamics simulations; SDS

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

Multifractal nature of heterogeneous dynamics and structures in glass forming ionic liquids

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Ionic liquids; Molecular dynamics simulations; Dynamic heterogeneity; Lévy distribution; Multifractality

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 8 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

Cellular uptake of transportan 10 and its analogs in live cells: Selectivity and structure-activity relationship studies

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Cell penetrating peptide; Structure-activity relationship; Uptake selectivity; Molecular dynamics simulations;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 8 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

Molecular dynamics simulations of the interactions and dispersion of carbon nanotubes in polyethylene oxide/water systems

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Carbon nanotube; Molecular dynamics simulations; Potential of mean force;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

The structure-function relationship of the Aspergillus fumigatuscyp51A L98H conversion by site-directed mutagenesis: The mechanism of L98H azole resistance

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Aspergillus fumigatus; Multi-azole resistance; cyp51A; Homology modelling; Molecular dynamics simulations;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

Plasma deposition of catalytic thin films: Experiments, applications, molecular modeling

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Catalytic films; Fuel cells; Photocatalytic TiO2; Gas sensor; Catalyst treatment; Molecular dynamics simulations;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

The formation of stacking fault tetrahedra in Al and Cu: II. SFT growth by successive absorption of vacancies generated by dipole annihilation

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Stacking fault tetrahedron; Dislocation dipole; Dislocation annihilation; Molecular dynamics simulations; Vacancy cluster

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

The formation of stacking fault tetrahedra in Al and Cu: I. Dipole annihilation and the nucleation stage

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Stacking fault tetrahedron; Dislocation dipole; Dislocation annihilation; Molecular dynamics simulations; Pipe diffusion

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

Atomistic processes of dislocation generation and plastic deformation during nanoindentation

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Dislocations; Molecular dynamics simulations; Nanoindentation; Cu single crystal; Dislocation analysis

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

Effects of higher oscillation modes on TM-AFM measurements

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; TM-AFM; Higher order oscillations; Finite element method; Molecular dynamics simulations

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 10 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

Atomistic simulation study of surfactant and polymer interactions on the surface of a fenofibrate crystal

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Crystal growth; Surfactants; Agglomeration; Molecular dynamics simulations

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 10 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

Highly accelerated simulations of glassy dynamics using GPUs: Caveats on limited floating-point precision

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; GPU computing; Molecular dynamics simulations; Dynamics of supercooled liquids

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 10 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

Nanovoid formation by change in amorphous structure through the annealing of amorphous Al2O3 thin films

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Nanovoid; Amorphous oxides; Elastic properties; Molecular dynamics simulations; Nanoporous

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 10 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

Partitioning of 2,6-Bis(1H-Benzimidazol-2-yl)pyridine fluorophore into a phospholipid bilayer: Complementary use of fluorescence quenching studies and molecular dynamics simulations

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Fluorescence quenching; Hydrogen boning; Excited state proton transfer; Membrane partitioning; Molecular dynamics simulations;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 10 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

Molecular dynamics simulations of rigid and flexible water models: Temperature dependence of viscosity

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Molecular dynamics simulations; Liquid water models; Viscosity calculations;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 10 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

3D atomistic simulation of fatigue behaviour of cracked single crystal of bcc iron loaded in mode III

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Fatigue; Mode III; bcc iron; Molecular dynamics simulations

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 10 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

From agonist to antagonist: Structure and dynamics of innate immune glycoprotein MD-2 upon recognition of variably acylated bacterial endotoxins

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; GlcN; d-p-glucosamine; KDO; 3-deoxy-d-manno-oct-2-ulosonic acid; LOS; lipooligosaccharide; LPS; lipopolysaccharide; MD; molecular dynamics; MD-2; myeloid differentiation protein 2; Endotoxin; MD-2; Molecular dynamics simulations; Lipid A; Lipopolysacchari

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 10 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

The formation of stacking fault tetrahedra in Al and Cu: III. Growth by expanding ledges

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Stacking fault tetrahedron; Growth; Ledge mechanism; Molecular dynamics simulations; Shockley dipole

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 11 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

Understanding the effects of carbocyclic sugars constrained to north and south conformations on RNA nanodesign

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; RNA; North constrained sugar; South constrained sugar; Molecular dynamics simulations; RNA structure deformations; RNA nanodesign

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 11 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

Identification of amino acid residues of a designed ankyrin repeat protein potentially involved in intermolecular interactions with CD4: Analysis by molecular dynamics simulations

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Ankyrin; CD4; HIV; Protein docking; Molecular dynamics simulations

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 11 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

Effect of uniaxial loading on the structural anisotropy and the dynamics of atoms of Cu50Zr50 metallic glasses within the elastic regime studied by molecular dynamics simulation

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Metallic glasses; Structural anisotropy; Elastic behavior; Molecular dynamics simulations

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 11 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

Deformation mechanisms, length scales and optimizing the mechanical properties of nanotwinned metals

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Twins; Dislocations; Plastic deformation; Ultrahigh strength; Molecular dynamics simulations

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 11 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

Dimerization and ligand binding affect the structure network of A2A adenosine receptor

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Intramolecular and intermolecular communication; Protein Structure Network; GPCR dimerization; Molecular Dynamics simulations

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 11 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

Biophysical and physicochemical methods differentiate highly ligand-efficient human D-amino acid oxidase inhibitors

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; D-amino acid oxidase; Biophysical techniques; Surface plasmon resonance; Isothermal titration calorimetry; Binding thermodynamics; Molecular dynamics simulations; Best-in-class compounds; Enzyme inhibitor; Holistic approachAI, asymmetry index; BBB, blood–

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 12 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

Molecular modeling and molecular dynamics simulation studies on pyrrolopyrimidine-based α-helix mimetic as dual inhibitors of MDM2 and MDMX

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; MDM2; MDMX; P53; Molecular dynamics simulations; Molecular docking

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 12 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

Molecular Dynamics Simulations of the Effect of the G-Protein and Diffusible Ligands on the β2-Adrenergic Receptor

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; GPCR; β2-adrenergic receptor; molecular dynamics simulations; protein–receptor interactions; 7TM receptor activationGPCR, G-protein-coupled receptor; β2AR, β2-adrenergic receptor; GαCT, C-terminal end of the Gα subunit; TM, transmembrane helix; IL, intrac

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 13 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

Water dynamics in chabazite

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Diffusion; Rotation; Water; Zeolites; Molecular dynamics simulations

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 13 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

Nucleic acid charge transfer: Black, white and gray

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Charge transfer mechanism; Nucleic acids; DNA; Peptide nucleic acid; Nucleic acid structure; Molecular dynamics simulations

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 14 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

Influence of the tip mass on the tip-sample interactions in TM-AFM

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; TM-AFM; Finite element method; Molecular dynamics simulations; Tip mass ratio; Higher harmonics;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 14 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

Dynamic properties of extremophilic subtilisin-like serine-proteases

Keywords: شبیه سازی پویایی مولکولی; Molecular dynamics simulations; Cold adaptation; Psychrophilic enzyme; Thermophilic enzyme; Salt bridge; Subtilisin;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 15 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه