دانلود مقالات ISI درباره Remd + ترجمه فارسی

پروتئین های تشکیل دهنده کانال ویروسی - چگونگی جمع آوری و دفورا کردن غشاهای چربی در سیلیکا

Viral channel forming proteins - How to assemble and depolarize lipid membranes in silico

Keywords: AMA; amantadine; BFM; bond fluctuation method; BST-2; bone marrow stromal cell antigen 2; CD; circular dichroism; CGMD; coarse-grained molecular dynamics; ClyA; cytolysin A; DHPC; dihexanoylphosphocholine; DPC; dodecylphosphocholine; E. coli; Escherichia

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 12 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

چالش های باز در غربالگری مجازی مبتنی بر ساختار: مدل سازی گیرنده، بررسی انعطاف پذیری هدف و توضیحات مولکول آب فعال سایت

Open challenges in structure-based virtual screening: Receptor modeling, target flexibility consideration and active site water molecules description

Keywords: Structure-based drug discovery; Homology modeling; Ligand docking; Virtual screening; Protein flexibility; Active site water molecules; GPCR; G Protein-coupled receptor; HM; homology modeling; HTD; high-throughput docking; LSHM; Ligand-steered homology mo

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 15 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

مکانیزم های آلوستریک گیرنده های هسته ای: بینش از شبیه سازی های محاسباتی

Allosteric mechanisms of nuclear receptors: insights from computational simulations

Keywords: AF-2; activation function 2; AP; alternative pocket; AR; androgen receptor; BF-3; binding function 3; DBD; DNA-binding domain; ER; estrogen receptor; GP; genomic pocket; GR; glucocorticoid receptor; H12; helix 12; HDX; hydrogen/deuterium exchange; LBD; li

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 37 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Synergistic approaches unraveling regulation and aggregation of intrinsically disordered β-amyloids implicated in Alzheimer's disease

Keywords: Aβ; amyloid beta; IDP; intrinsically disordered proteins; REMD; replica exchange molecular dynamics; TMAO; trimethylamine N-oxide; AD; Alzheimer's disease; OPLS; optimized potentials for liquid simulations; TEM; transmission electron microscopy; ThT; t

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2018 سفارش ترجمه

The influences of E22Q mutant on solvated 3Aβ11-40 peptide: A REMD study

Keywords: E22Q mutant; Aβ oligomer; REMD; Binding free energy; Trimer;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 19 صفحه سال انتشار : 2018 سفارش ترجمه

Folding/unfolding of protein Trp cage in aqueous osmolyte solutions under polar confinement

Keywords: Trp cage; REMD; Polar confinement; Urea; TMAO;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 20 صفحه سال انتشار : 2017 سفارش ترجمه

Effect of nonpolar confinement on protein Trp cage conformation in aqueous osmolyte solutions

Keywords: Urea; TMAO; Trp cage; Confinement; REMD;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 21 صفحه سال انتشار : 2017 سفارش ترجمه

Folding of SAM-II riboswitch explored by replica-exchange molecular dynamics simulation

Keywords: Riboswitch; Bacteria; REMD; Folding dynamics;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 5 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

Recent advances in QM/MM free energy calculations using reference potentials

Keywords: ABF; adaptive biasing force; CG; coarse-grained; EVB; empirical valence bond; FEP; free energy perturbation; LRA; linear response approximation; MD; molecular dynamics; PD; paradynamics; PMF; potential of mean force; QM/MM; quantum mechanics/molecular mec

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 12 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

Modular reweighting software for statistical mechanical analysis of biased equilibrium data

Keywords: Statistical reweighting; WHAM; REMD; Umbrella sampling;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 5 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

Mutual solubilities study for binary mixtures of dipropylene glycol dimethyl ether and water via molecular dynamics simulation and AMOEBA polarizable force field

Keywords: AMOEBA force field; Molecular dynamics; REMD; Phase diagram; LLE

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

Structure and stability of the lamin A tail domain and HGPS mutant

Keywords: AA; amino acid; CD; circular dichroism; DLS; dynamic light scattering; DSC; differential scanning calorimetry; HGPS; Hutchinson-Gilford progeria syndrome; Ig; immuno-globulin; REMD; replica exchange method; SMD; steered molecular dynamics; WLC; worm-lik

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2011 سفارش ترجمه

Insights into the folding pathway of the Engrailed Homeodomain protein using replica exchange molecular dynamics simulations

Keywords: Protein folding; Molecular dynamics simulations; REMD; Engrailed Homeodomain; PCA

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 11 صفحه سال انتشار : 2010 سفارش ترجمه

Energy landscape of the ribosomal decoding center

Keywords: Ribosome; Decoding center; Simulation; Replica; REMD; RNA; tRNA selection; Base flip

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2006 سفارش ترجمه