کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
10532593 961630 2013 13 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Comparison of quantitative spectral similarity analysis methods for protein higher-order structure confirmation
ترجمه فارسی عنوان
مقایسه روش های تجزیه و تحلیل تقریبی طیفی کمی برای تایید ساختار پروتئینی بالاتر
ترجمه چکیده
تکنیکهای اسپکتروسکوپی نوری و ارتعاشی ابزار مهمی برای ارزیابی ساختارهای ثانویه و ثانویه پروتئین ها هستند. این تکنیک های اسپکتروسکوپی به طور معمول در توسعه بیوفرمارکتیو برای توضیح ویژگی های ساختاری محصولات پروتئین، برای ارزیابی تأثیر شرایط پردازش و ذخیره سازی بر کیفیت محصول و ارزیابی قابلیت مقایسه محصولات پروتئینی قبل و بعد از تغییرات تولید، مورد استفاده قرار می گیرد. به طور معمول، میزان تشابه بین دو طیف، به صورت بصری تعیین شده است. به علاوه نیاز به مقدار قابل توجهی از آموزش و تجربیات تحلیل گر، بررسی بصری طیفها ذاتا ذهنی است و هرگونه تعیین قابلیت مقایسه بر اساس تجزیه و تحلیل بصری طیفها دلخواه است. در اینجا ما در مورد یک روش کلی برای ارزیابی مناسب بودن روش های عددی برای محاسبه شباهت طیفی بحث می کنیم و سپس روش را برای مقایسه چهار روش تشابه طیفی تقسیم می کنیم: ضریب همبستگی، سطح همپوشانی طیفی، الگوریتم همبستگی مشتق شده و روش های مختلف طیفی . در حالی که موثرترین روش تشابه طیفی ممکن است به کاربرد خاص بستگی داشته باشد، هر چهار رویکرد نسبت به ارزیابی بصری برتر است و هر کدام برای ارزیابی میزان تشابه بین طیف ها مناسب است.
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه شیمی شیمی آنالیزی یا شیمی تجزیه
چکیده انگلیسی
Optical and vibrational spectroscopic techniques are important tools for evaluating secondary and tertiary structures of proteins. These spectroscopic techniques are routinely applied in biopharmaceutical development to elucidate structural characteristics of protein products, to evaluate the impact of processing and storage conditions on product quality, and to assess comparability of a protein product before and after manufacturing changes. Conventionally, the degree of similarity between two spectra has been determined visually. In addition to requiring a significant amount of analyst training and experience, visual inspection of spectra is inherently subjective, and any determination of comparability based on visual analysis of spectra is therefore arbitrary. Here, we discuss a general methodology for evaluating the suitability of numerical methods to calculate spectral similarity, and then we apply the methodology to compare four quantitative spectral similarity methods: the correlation coefficient, area of spectral overlap, derivative correlation algorithm, and spectral difference methods. While the most effective spectral similarity method may depend on the particular application, all four approaches are superior to visual evaluation, and each is suitable for assessing the degree of similarity between spectra.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Analytical Biochemistry - Volume 434, Issue 1, 1 March 2013, Pages 153-165
نویسندگان
, , , , , ,