کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
10871853 | 1074088 | 2011 | 5 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
A novel force field parameter optimization method based on LSSVR for ECEPP
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
علوم کشاورزی و بیولوژیک
دانش گیاه شناسی
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
In this paper, we propose a novel force field parameter optimization method based on LSSVR and optimize the torsion energy parameters of ECEPP force field. In this method force field parameter optimization problem is turned into a support vector regression problem. Protein samples for regression model training are chosen from Protein Data Bank. The experiments show that the optimized force-field parameters make both α-helix and β-hairpin structures more consistent with the experimental implications than the original parameters.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: FEBS Letters - Volume 585, Issue 6, 23 March 2011, Pages 888-892
Journal: FEBS Letters - Volume 585, Issue 6, 23 March 2011, Pages 888-892
نویسندگان
Yunling Liu, Lan Tao, Jianjun Lu, Shuo Xu, Qin Ma, Qingling Duan,