کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
10885827 1079907 2014 16 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Search strategies and evaluation in protein-protein docking: principles, advances and challenges
ترجمه فارسی عنوان
استراتژی های جستجو و ارزیابی پیوند پروتئین و پروتئین: اصول، پیشرفت ها و چالش ها
ترجمه چکیده
پیوند پروتئین-پروتئین توجه بیشتری را در تحقیقات کشف مواد مخدر، هدف قرار دادن تعاملات پروتئین-پروتئین با توجه به پتانسیل آن در پیش بینی متابولیسم پروتئین-پروتئین و شناسایی باقی مانده های "نقطه ی داغ" در رابط پروتئین-پروتئین، افزایش می دهد. با توجه به کمبود نسبی اطلاعات در مورد سایت های اتصال و این واقعیت که پروتئین ها عموما بزرگتر از لیگاند هستند، الگوریتم های جستجو و روش های ارزیابی برای پیوند پروتئین و پروتئین تا حدودی از آن ها برای اتصال پروتئین لیگاد متفاوت است و از این رو، نیاز به استراتژی های مختلف تحقیقاتی دارند. در اینجا، ما مفاهیم، ​​اصول و پیشرفت های استراتژی های جستجوی فعلی و روش های ارزیابی پیوند پروتئین-پروتئین را بررسی می کنیم. ما همچنین درباره چالش ها و محدودیت های فعلی، و همچنین جهت های آینده، از رویکردهای ایجاد شده بحث می کنیم.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی بیوتکنولوژی یا زیست‌فناوری
پیش نمایش مقاله
استراتژی های جستجو و ارزیابی پیوند پروتئین و پروتئین: اصول، پیشرفت ها و چالش ها
چکیده انگلیسی
Protein-protein docking is attracting increasing attention in drug discovery research targeting protein-protein interactions, owing to its potential in predicting protein-protein interactions and identifying 'hot spot' residues at the protein-protein interface. Given the relative lack of information about binding sites and the fact that proteins are generally larger than ligand, the search algorithms and evaluation methods for protein-protein docking differ somewhat from those for protein-ligand docking and, hence, require different research strategies. Here, we review the basic concepts, principles and advances of current search strategies and evaluation methods for protein-protein docking. We also discuss the current challenges and limitations, as well as future directions, of established approaches.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Drug Discovery Today - Volume 19, Issue 8, August 2014, Pages 1081-1096
نویسندگان
,