Text mining for systems biology

ارتباطات علمی در پزشکی زیست پزشکی، به طور کلی، هنوز بر اساس متن است. تکنولوژی های استخراج متن برای استخراج خودکار اطلاعات مفید پزشکی از متن غیر ساختاری که می تواند به طور مستقیم برای مدل سازی زیست شناسی سیستم مورد استفاده قرار گیرد، طی چند سال گذشته به طور قابل توجهی بهبود یافته است. در این بررسی، ما اهمیت به رسمیت شناختن نهاد نام و استخراج ارتباط را به عنوان رویکردهای اساسی که مربوط به زیست شناسی سیستم می باشد، تأکید می کنیم. علاوه بر این، ما تاکید بر نقش چالش های معیار سنجش علمی سازمان یافته که منعکس کننده وضعیت فعلی تکنولوژی استخراج متن هستند و در زمینه حرکت به سمت همه ی بخش ها اهمیت دارد. با توجه به توسعه بیشتر بین رشته ای از سیستم های هسته شناسی مبتنی بر زیست شناسی و تمرین های فیزیکی، ما انتظار داریم که در آینده به طور پیوسته تاثیر فناوری متن متمرکز بر زیست شناسی سیستم ها افزایش یابد.