کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
10971382 1106308 2013 16 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Evaluation of phenotypic markers in full genome sequences of avian influenza isolates from California
ترجمه فارسی عنوان
ارزیابی مارکرهای فنوتیپی در توالی ژنوم کامل از جدایه های آنفلوآنزای مرغی از کالیفرنیا
کلمات کلیدی
ویروس آنفولانزای مرغی نظارت، سازگاری میزبان، نشانگرهای فنوتیپ، تحقیق در مورد آنفلوانزا، بانک اطلاعاتی،
ترجمه چکیده
ما نشانگرهای فنوتیپی را در توالی کامل ژنوم از جدایه های آنفولانزای مرغی برای شناسایی گونه های پرندگان با افزایش پتانسیل انتقال و پاتوژنز در پستانداران ارزیابی کردیم. از 149 نشانگر مورد بررسی، 67 مورد در توالی توافق از 206 جدایه های گوسفند مثبت بودند. تجزیه و تحلیل داده های توالی عمقی در یک زیرمجموعه از 24 جدایه نشان داد که 344 زیر جمعیت در موقعیت های نشانگر رخ داده است. نشانگرهای در زیر جمعیت به طور معنی داری بیشتر منفی بودند (344/258) نسبت به مثبت (34/86)، اما تقریبا همه زیرمجموعه های مثبت نشانگر (78/86) با توالی های توافق توافق مارکر-منفی ارتباط داشتند. تجزیه و تحلیل ما نشان داد که تفاوت معنی داری در نشانگرهای مهم بین جدایه های گوسفند وجود دارد و نشان داد که توالی های توافق کامل پتانسیل جداسازی برای افزایش انتقال و پاتوژنز در پستانداران را به طور کامل انتقال نمی دهد.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری علوم کشاورزی و بیولوژیک علوم دامی و جانورشناسی
پیش نمایش مقاله
ارزیابی مارکرهای فنوتیپی در توالی ژنوم کامل از جدایه های آنفلوآنزای مرغی از کالیفرنیا
چکیده انگلیسی
We evaluated phenotypic markers in full-genome sequences of avian influenza isolates to identify avian strains with increased potential for transmission and pathogenicity in mammals. Of 149 markers examined, 67 were positive in the consensus sequences from 206 avian isolates. Analysis of deep sequencing data in a subset of 24 isolates revealed that 344 subpopulations occurred at marker positions. Markers in subpopulations were significantly more likely to be negative (258/344) than positive (86/344), but nearly all of the marker-positive subpopulations (78/86) were associated with marker-negative consensus sequences. Our analysis revealed significant variation in important markers among avian isolates, and showed that consensus sequences do not fully convey an isolate's potential for increased transmissibility and pathogenicity in mammals.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Comparative Immunology, Microbiology and Infectious Diseases - Volume 36, Issue 5, September 2013, Pages 521-536
نویسندگان
, , , , , ,