کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
10973509 1108015 2014 11 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Comparison of single-trait to multi-trait national evaluations for yield, health, and fertility1
ترجمه فارسی عنوان
مقایسه ارزیابیهای تک صفتی چند جانبه برای عملکرد، سلامت و باروری 1
کلمات کلیدی
مدل حیوانی، ارزیابی ژنتیکی، صفات همبستگی، بهترین پیش بینی خطی بی طرفانه،
ترجمه چکیده
نرم افزار انعطاف پذیر برای جایگزینی برنامه های حیوانی موجود برای ارزیابی ژنتیک ملی طراحی شده است. بهبود مدل شامل (1) پردازش چند ضلعی، (2) متغیرهای چندگانه ثابت و رگرسیون، (3) مدل های متفاوت برای صفات مختلف، (4) رگرسیون های تصادفی و (5) داده های خارجی شامل استفاده از سوابق شبه. بهبود محاسباتی شامل (6) پردازش موازی، (7) تغییر متغیرهای کلاس را به اعداد معادله در برنامه، به طوری که اثرات برآورده شده با شماره های شناسایی اصلی خروجی، و (8) قابلیت اطمینان محاسبه در همان برنامه. هنگامی که به 3 صفات باروری از 27،971،895 گاو و تلیسه اعمال شد، مدل جدید، میزان بارداری دختران را به عنوان یک ویژگی همبستگی برای بهبود ارزیابی میزان تسلیح هلی کوپتر و گاو برای حیوانات سالخورده و در دوره گله ای که پرونده ها از دست رفته، و همچنین اطلاعاتی از کراس برنده ها . هنگامی که به 7 صفات و 76،846،327 پروتئین شیردهی از 30،064،300 گاو اعطا شد، دستاوردهای دقت برای عملکرد و نمره سلول های سوماتیک، متوسط ​​میزان بارداری دختران و بیشتر برای زندگی تولید گاوهای نوظهور در مقایسه با ارزیابی تک صفر بود. برای گاوهای بسیار قدیمی، سود چند منظوره برای پروتئین نیز زیاد بود زیرا پرونده های شیردهی تنها برای شیر و چربی در دسترس بود. زندگی مولد صریح با روش های دقیق و تقریبی محاسبه شد؛ با این حال، اطلاعات همبسته از انطباق حذف شد، کاهش مزایای مدل جدید بر روی نرم افزار قبلی. برآورد تفاوت های نژادی، افسردگی درونی و هتروزیس مشابه تخمین های قبلی بود. برآوردهای جدید برای نرخ تخمک به دست آمد. پیش بینی ها با قطع 4 سال داده ها مقایسه شد و اعتبار سنجی روند ژنتیکی به تمام ترکیبات نژادی-صفات اعمال شد. تخمینی از روند روند افزایش در همبستگی در طول زمان. ترکیب داده های خارجی ارتباطات بیش از 0.98 برای جدید با ارزیابی های قبلی از گاوهای هولشتاین خارجی، اما برای دیگر نژادها کمتر است. مدل 7-صفر نیاز به 35 گیگابایت حافظه داشت و 3 دسامبر برای استفاده از 7 پردازنده همگام سازی شد. نرم افزار جدید برای صفات باروری در سال 2013 به اجرا گذاشته شده و برای اجرای با عملکرد، نمره سلول های مفصلی و زندگی تولیدی در سال 2014 برنامه ریزی شده است. بازبینی مجدد از مدل ها و نرم افزارها ممکن است در آینده نزدیک برای تعیین پیش تعیین ژنوم مورد نیاز باشد.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری علوم کشاورزی و بیولوژیک علوم دامی و جانورشناسی
پیش نمایش مقاله
مقایسه ارزیابیهای تک صفتی چند جانبه برای عملکرد، سلامت و باروری 1
چکیده انگلیسی
Flexible software was designed to replace the current animal model programs used for national genetic evaluations. Model improvements included (1) multi-trait processing, (2) multiple fixed class and regression variables, (3) differing models for different traits, (4) random regressions, and (5) foreign data included using pseudo-records. Computational improvements included (6) parallel processing, (7) renumbering class variables to equation numbers within the program so that estimated effects are output with original identification numbers, and (8) reliability computed within the same program. When applied to 3 fertility traits of 27,971,895 cows and heifers, the new model used daughter pregnancy rate as a correlated trait to improve heifer and cow conception rate evaluations for older animals and in herd-years where records are missing, and also added information from crossbreds. When applied to 7 traits and 76,846,327 lactation records of 30,064,300 cows, gains in accuracy were small for yield and somatic cell score, moderate for daughter pregnancy rate, and larger for productive life for recent bulls compared with single-trait evaluations. For very old bulls, multi-trait gains were also large for protein because lactation records were available only for milk and fat. Multi-trait productive life was computed with exact rather than approximate methods; however, correlated information from conformation was excluded, reducing advantages of the new model over the previous software. Estimates of breed differences, inbreeding depression, and heterosis were similar to previous estimates; new estimates were obtained for conception rates. Predictions were compared by truncating 4 yr of data, and genetic trend validation was applied to all breed-trait combinations. The estimates of trend account for increases in inbreeding across time. Incorporation of foreign data gave correlations above 0.98 for new with previous evaluations of foreign Holstein bulls, but lower for other breeds. The 7-trait model required 35 GB of memory and 3 d to converge using 7 processors. The new software was implemented for fertility traits in 2013 and is scheduled for implementation with yield, somatic cell score, and productive life in 2014. Further revision of the models and software may be needed in the near future to account for genomic preselection.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Dairy Science - Volume 97, Issue 12, December 2014, Pages 7952-7962
نویسندگان
, , , , ,