کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
10978471 1108057 2013 13 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Effects of a national genomic preselection on the international genetic evaluations
ترجمه فارسی عنوان
اثرات انتخاب ژنومی ملی بر ارزیابی ژنتیک بین المللی
کلمات کلیدی
ترجمه چکیده
انتخاب ژنومی گاوهای جوان در حال حاضر به طور گسترده در طرح های پرورش لبنیات، به ویژه در نژاد هولشتاین اجرا می شود. با این حال، اگر این گام در مدل های ارزیابی ژنتیکی به حساب نمی آید، ارزش های پرورش ملی برای گاوهای باقی مانده توسط پیش تعیین شده ژنتیکی و نسل آنها با تعصب برآورد می شود. به این ترتیب کشورهای عضو شرکت کننده در ارزیابی های ژنتیک بین المللی، مجموعه ای از داده های انتخاب شده و احتمالی را به مرکز اینتربول (دانشگاه سوئد، دانشگاه علوم کشاورزی سوئد) ارائه می دهند. هدف از این مطالعه نشان دادن شواهدی از تعصب در سطح بین المللی به دلیل مرحله ژنومی انتخاب اولیه در طرح های ملی پرورش است. نتیجه یک انتخاب ژنومی برای ارزیابی های بین المللی (به عنوان مثال، با استفاده از ارزش های برآورد شده برآورد شده برآورده شده و برابری شده ملی) با استفاده از ارزش واقعی ارزش تخمینی ملی تخمینی به عنوان پروکسی برای ارزش های پرورش ژنتیکی افزایش یافته است. داده ها برای 3 کشور با جمعیت زیادی از گاو هولشتاین ارائه شده است. ارزش های بین المللی پرورش از سناریوهای شبیه سازی شده با ارزش های بین المللی پرورش با استفاده از تمام داده های موجود، که به نظر کامل و بی طرفانه است، مقایسه شد. اختلال در میان گاوهای جوان نگهداری شده توسط پیش تعیین شده ژنتیکی و معاصران آنها در سایر کشورها اندازه گیری شد. نتایج با استفاده از صفات اندازه گیری در داخل کشور و کشور مبدا گاوهای جوان مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. معلوم شد که ارسال اطلاعات پیشنهادی، هرچند براساس اطلاعات ژنومی، تعصب در ارزیابیهای بین المللی ایجاد کرده است، جریمه کردن گاوهای جوان از کشور ارسال اطلاعات نادرست. این نیز بر گاوهای جوان از کشورهای دیگر تاثیر گذاشت. ارسال اطلاعات محرمانه بیشتر بر کیفیت ارزیابی های بین المللی تأثیر می گذارد. این مطالعه ابتدا اهمیت حسابداری برای انتخاب ژنوم در سطح ملی را اولویت می دهد. علاوه بر این، ارائه کلیه اطلاعات موجود برای حفظ کیفیت ارزیابی های ژنتیک بین المللی پس از پیاده سازی مرحله پیش تعیین ژنوم ضروری است.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری علوم کشاورزی و بیولوژیک علوم دامی و جانورشناسی
پیش نمایش مقاله
اثرات انتخاب ژنومی ملی بر ارزیابی ژنتیک بین المللی
چکیده انگلیسی
Genomic preselection of young bulls is now widely implemented in dairy breeding schemes, especially in the Holstein breed. However, if this step is not accounted for in genetic evaluation models, the national breeding values of bulls retained by a genomic preselection and of their progeny are estimated with bias. It follows that countries participating in international genetic evaluations will provide a selected and possibly biased set of data to the Interbull Centre (Swedish University of Agricultural Sciences, Uppsala, Sweden). The objective of the study was to show evidence of bias at the international level due to a genomic preselection step in national breeding schemes. The consequence of a genomic preselection for the international evaluations (i.e., using selected and biased national estimated breeding values) was simulated using actual national estimated breeding values as a proxy for genomically enhanced breeding values. Data were provided for 3 countries with a large population of Holstein bulls. International breeding values from simulated scenarios were compared with international breeding values using all available data, assumed to be complete and unbiased. Bias was measured among young bulls retained by a genomic preselection and their contemporaries in other countries. The results were analyzed by traits measured within each country and by country of origin of the young bulls. It turned out that sending preselected data, though based on genomic information, created bias in international evaluations, penalizing young bulls from the country sending the incorrect data. It also had an effect on the young bulls from the other countries. Sending biased data further affected the quality of international evaluations. This study underlines the importance of accounting for genomic preselection at the national level first. Moreover, submitting all available data appeared essential to maintain the quality of the international genetic evaluations after implementation of a genomic preselection step.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Dairy Science - Volume 96, Issue 5, May 2013, Pages 3272-3284
نویسندگان
, , ,