Decoding the non-coding genome: Opportunities and challenges of genomic and epigenomic consortium data

داده های توالی نسل های عمومی موجود در دهه اخیر به ویژه از طریق کار چندین کنسرسیوم بین المللی گسترش یافته است. این تلاش های مشترک، آزمایش های متعددی را انجام داده اند که ویژگی های متنوعی از تنظیم ژن را مشخص می کنند، مانند ساختار کروماتین در سراسر ژنوم، فعالیت رونویسی و اتصال فاکتور رونویسی، به هزاران نمونه بیوپسی از چندین موجود زنده. تجزیه و تحلیل محاسباتی جدید و روش های آماری نتایج یافته ها را به تغییرات بیان ژن و تغییرات فنوتیپی پیوند می دهد. تجزیه و تحلیل یکپارچه از این مجموعه داده ها دارای توانایی انقلابی در درک ما از توسعه ارگانیسم، تمایز سلول، پاسخ سلولی به محرک ها و مکانیزم های بیماری است. با این حال، روش های استاندارد برای دسترسی به داده ها، پردازش داده های یکپارچه و تجزیه و تحلیل یکپارچه به طور عمده وجود ندارد، مانع از تاثیر این تلاش ها. در اینجا، پیشرفت های ساخته شده توسط کنسرسیوم و جهت تلاش های مداوم، و همچنین چالش های موجود در دسترسی و تجزیه و تحلیل داده های کنسرسیومی قابل دسترس و ابزارهای جدید برای رسیدگی به این چالش ها را مرور می کنیم.