کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
11033013 1642812 2018 20 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Extracting complementary insights from molecular phenotypes for prioritization of disease-associated mutations
ترجمه فارسی عنوان
استخراج مفاهیم مکمل از فنوتیپ های مولکولی برای اولویت بندی جهش های مرتبط با بیماری
ترجمه چکیده
پیشرفت های سریع در تکنولوژی توالی نسل بعدی منجر به انفجار داده های توالی کامل / ژنوم شده است، و فرصتی بی سابقه ای برای شناسایی انواع بیماری ها و ویژگی های مربوط به انسان در مقیاس وسیع ایجاد می کند. تا به امروز، پارادایمی که مدتهاست استفاده شده است، تقریبهای مبتنی بر تناسب اندام را برای تحمیل دادههای این توافق همیشه در حال گسترش در بیماریها به کار میگیرد. با این حال، در حالی که این رویکرد به شدت انواع را در زیر محدودیت تکاملی شناسایی می کند، آن را نتواند بینش مولکولی ارائه دهد. علاوه بر این، پدیده های پیچیده بیماری اغلب مفروضات استاندارد یک فنوتیپ ارگانیسم مستقیم را به نفع تاثیر کلی تناسب می رساند. در اینجا ما در مورد پتانسیل پارادایم فنوتیپی مولکولی به منظور شناسایی جهش های ناشی از بیماری های نامشخص از پس زمینه ژنتیکی انسان بحث می کنیم. با ارائه ارتباط مستقیم بین جهش های تک نوکلئوتیدی و فنوتیپ های ارگانیسم و ​​سلولی قابل مشاهده در ارتباط با بیماری، ما پیشنهاد می کنیم که فنوتیپ های مولکولی می توانند به راحتی در کنار متدولوژی های مبتنی بر تناسب اندام به منظور ارائه تفاهم متقابل به اثرات کاربردی جهش های انسانی مورد استفاده قرار گیرند. در نهایت، ما در مورد چگونگی رویکردهای یکپارچه بین فنوتیپ های مولکولی و دیدگاه های مبتنی بر تناسب، بینش جدیدی را در مورد مکانیزم های مولکولی موتاسیون های مرتبط با بیماری توجیه می کنیم، در حالی که ارائه یک پلت فرم برای تفسیر بهتر اپیستازی در بیماری های انسانی است.
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه مهندسی کامپیوتر علوم کامپیوتر (عمومی)
پیش نمایش مقاله
استخراج مفاهیم مکمل از فنوتیپ های مولکولی برای اولویت بندی جهش های مرتبط با بیماری
چکیده انگلیسی
Rapid advances in next-generation sequencing technology have resulted in an explosion of whole-exome/genome sequencing data, providing an unprecedented opportunity to identify disease- and trait-associated variants in humans on a large scale. To date, the long-standing paradigm has leveraged fitness-based approximations to translate this ever-expanding sequencing data into causal insights in disease. However, while this approach robustly identifies variants under evolutionary constraint, it fails to provide molecular insights. Moreover, complex disease phenomena often violate standard assumptions of a direct organismal phenotype to overall fitness effect relationship. Here we discuss the potential of a molecular phenotype-oriented paradigm to uniquely identify candidate disease-causing mutations from the human genetic background. By providing a direct connection between single nucleotide mutations and observable organismal and cellular phenotypes associated with disease, we suggest that molecular phenotypes can readily incorporate alongside established fitness-based methodologies to provide complementary insights to the functional impact of human mutations. Lastly, we discuss how integrated approaches between molecular phenotypes and fitness-based perspectives facilitate new insights into the molecular mechanisms underlying disease-associated mutations while also providing a platform for improved interpretation of epistasis in human disease.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Current Opinion in Systems Biology - Volume 11, October 2018, Pages 107-116
نویسندگان
, , , ,