کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
2050938 | 1074186 | 2008 | 6 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
The transmembrane topology of Batten disease protein CLN3 determined by consensus computational prediction constrained by experimental data
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
علوم کشاورزی و بیولوژیک
دانش گیاه شناسی
پیش نمایش صفحه اول مقاله

چکیده انگلیسی
The CLN3 gene encodes an integral membrane protein of unknown function. Mutations in CLN3 can cause juvenile neuronal ceroid lipofuscinosis, or Batten disease, an inherited neurodegenerative lysosomal storage disease affecting children. Here, we report a topological study of the CLN3 protein using bioinformatic approaches constrained by experimental data. Our results suggest that CLN3 has a six transmembrane helix topology with cytoplasmic N and C-termini, three large lumenal loops, one of which may contain an amphipathic helix, and one large cytoplasmic loop. Surprisingly, varied topological predictions were made using different subsets of orthologous sequences, highlighting the challenges still remaining for bioinformatics.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: FEBS Letters - Volume 582, Issue 7, 2 April 2008, Pages 1019–1024
Journal: FEBS Letters - Volume 582, Issue 7, 2 April 2008, Pages 1019–1024
نویسندگان
Timothy Nugent, Sara E. Mole, David T. Jones,