Phenotypic and genetic characterization of enteropathogenic Escherichia coli (EPEC) and enteroaggregative E. coli (EAEC) from diarrhoeal and non-diarrhoeal children in Libya

A total of 50 Escherichia coli strains isolated in a Libyan hospital (20 from children with diarrhoea and 30 from healthy children) were investigated for their pathotypes and virulence traits. Altogether nine eae-positive (enteropathogenic E. coli, EPEC) and nine aggR-positive (enteroaggregative E. coli, EAEC) strains were identified. Significantly (P=0.001) more EPEC strains were identified from diarrhoeal patients (n=8) than from healthy controls (n=1), while six EAEC strains were identified from diarrhoeal and three from healthy children. Typical (eae+, EAF+, bfp+) EPEC strains (n=6) belonged to classical EPEC serogroups O55, O114, O127 and showed localized adherence on Hela cells. EAEC strains revealed genetic heterogeneity but uniformly adhered to HeLa cultures in an enteroaggregative adherence pattern. Antibiotic resistance frequently, characterized the strains. Sixty-eight percentage of the strains were resistant against at least one antibiotic and 30% harbored a class 1 integron independently of their clinical background. This is the first report from North Africa demonstrating the significance of EPEC and EAEC.

RésuméLe pathotype et la virulence ont été déterminés sur 50 souches d'Escherichia coli isolées d'un hôpital de Libye (20 provenant d'enfants atteints de diarrhées et 30 d'enfants sains). En tout, nine souches eae-positives (E. coli entéropathogénique, EPEC) et nine souches aggR-positives (E. coli enteroaggrégative, EAEC) ont été identifiées. Significativement (P=0.001) plus de souches EPEC ont été identifiées à partir des patients diarrhéiques (n=8) qu'à partir des témoins sains (n=1), tandis que six souches EAEC ont été identifiées à partir de diarrhéiques et three à partir d'enfants sains. Les souches EPEC typiques (eae+, EAF+, bfp+) (n=6) appartiennent aux sérogroupes EPEC classiques O55, O114, O127 et présentent une adhérence localisée sur des cellules Hela. Les souches EAEC présentent une hétérogénéité génétique mais adhérent uniformément aux cultures Hela dans un ‘groupe d'adhérence entéroaggregative’. La résistance aux antibiotiques caractérise fréquemment les souches. Soixante huit pourcent des souches sont résistantes à au moins un antibiotique tandis que 30% des souches possèdent l'intégron de classe 1 indépendamment de leur passé clinique. Ceci représente le premier rapport d'Afrique du Nord démontrant l'importance des EPEC et des EAEC.