Comparative transcriptomic analysis between an artificially induced SIRS in healthy individuals and spontaneous sepsis

Sepsis is defined as a syndrome combining a systemic inflammatory response with a documented infection. It may progress to more serious cases such as septic shock following the failure of one or more organs and the emergence of hemodynamic defects. Assuming that the emergence of serious septic syndromes may be partially explained by the early loss of regulation of the inflammatory response, we decided to compare, in a transcriptomic perspective, the biological mechanisms expressed during an induced systemic inflammatory response with those expressed during severe septic syndromes. By using open-access transcriptomic databases, we first studied the kinetics of an induced inflammatory response. The use of functional analysis helped us identify discriminating biological mechanisms, such as the mTOR signaling pathway, between the pathological cases of sepsis and non-pathological (i.e., the artificially induced SIRS) cases.

RésuméLe sepsis se définit comme un syndrome combinant une réponse inflammatoire systémique à une infection documentée. Celui-ci peut évoluer vers des cas plus graves, tels que le choc septique consécutif à la défaillance d’un ou de plusieurs organes et l’apparition d’une défaillance hémodynamique. Partant de l’hypothèse que l’apparition de syndromes septiques graves est la conséquence d’une perte de contrôle précoce dans la régulation de la réponse inflammatoire, nous avons décidé de comparer d’un point de vue transcriptomique les mécanismes opérant lors d’une réponse inflammatoire systémique induite et contrôlée à ceux exprimés dans les syndromes septiques graves. À partir de bases de données transcriptomiques en libre accès, nous avons étudié la cinétique d’une réponse inflammatoire induite. L’utilisation d’outils bioinformatiques d’analyse fonctionnelle a permis d’identifier des mécanismes biologiques discriminants, tels que la voie de signalisation mTOR, entre des cas pathologiques de sepsis et des cas de SIRS induits non pathologiques.