کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
2816151 1159917 2014 11 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Sequence determinants of prokaryotic gene expression level under heat stress
ترجمه فارسی عنوان
تعیین توالی ژن بیان ژن پروکاریوتیک تحت استرس گرمایی
کلمات کلیدی
ترجمه چکیده
بیان ژن پروکاریوت وابسته به محیط است و درجه حرارت در شکل دهی مشخصات بیان ژن نقش مهمی دارد. تشخیص مکانیزم های تنظیم بیان ژن مربوط به درجه حرارت در سال های اخیر، به خصوص به دست آوردن داده های ترانسکتیکوم و پروتئومیت توسط تکنیک های با کارایی بالا، موجب شده است. با این حال، بسیاری از آثار قبلی متمرکز بر ویژگی بیان ژن بیان ارگانیسم های فردی بوده اند و تلاش های کمی برای تشریح مشترکیت در میان ارگانیسم ها، مخصوصا برای ویژگی های ژن ژن انجام شده است. در این گزارش، داده های ترانسکتیکوم و پروتئومیتی تحت شرایط تنش گرما را از ادبیات اخیر منتشر شده جمع آوری کردیم و تعیین کننده های توالی برای بیان سطح ژن های واکنش گرما در لایه های مختلف بودیم. نتایج ما نشان داد که وجود ویژگی های توالی در بین ارگانیسم ها برای ژن های متفاوت بیان شده در شرایط تنش گرما وجود دارد. بعضی از ویژگی ها به شرایط گرماسنجی نسبت داده می شوند در حالی که برخی از آنها تحت تأثیر عملکرد ژن قرار دارند. تعیین کننده توالی نشان دهنده سطح بیان بیان ژن باکتریایی تحت تنش گرمائی دانش را در مورد عوامل تنظیم کننده بیان ژن پروکراتیت پاسخ می دهد که به تغییر شرایط محیطی بستگی دارد. علاوه بر این، مقایسات تطبیقی ​​ترموفیلم برای تشخیص شباهت و عدم هماهنگی تعیین کننده های توالی برای پاسخ به استرس گرما و سازگاری با دمای بالای زیستگاه انجام شده است، که بیانگر چشم انداز پیچیده بیان ژن مربوط به یک عامل فیزیکی دما است .
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی ژنتیک
پیش نمایش مقاله
تعیین توالی ژن بیان ژن پروکاریوتیک تحت استرس گرمایی
چکیده انگلیسی
Prokaryotic gene expression is environment-dependent and temperature plays an important role in shaping the gene expression profile. Revealing the regulation mechanisms of gene expression pertaining to temperature has attracted tremendous efforts in recent years particularly owning to the yielding of transcriptome and proteome data by high-throughput techniques. However, most of the previous works concentrated on the characterization of the gene expression profile of individual organism and little effort has been made to disclose the commonality among organisms, especially for the gene sequence features. In this report, we collected the transcriptome and proteome data measured under heat stress condition from recently published literature and studied the sequence determinants for the expression level of heat-responsive genes on multiple layers. Our results showed that there indeed exist commonness and consistent patterns of the sequence features among organisms for the differentially expressed genes under heat stress condition. Some features are attributed to the requirement of thermostability while some are dominated by gene function. The revealed sequence determinants of bacterial gene expression level under heat stress complement the knowledge about the regulation factors of prokaryotic gene expression responding to the change of environmental conditions. Furthermore, comparisons to thermophilic adaption have been performed to reveal the similarity and dissimilarity of the sequence determinants for the response to heat stress and for the adaption to high habitat temperature, which elucidates the complex landscape of gene expression related to the same physical factor of temperature.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Gene - Volume 551, Issue 1, 1 November 2014, Pages 92-102
نویسندگان
, , , , ,