کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
2819145 | 1569908 | 2008 | 5 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
A stochastic method for the reconstruction of protein structures from one-dimensional structural profiles
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
ژنتیک
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
We discuss a computational approach for reconstructing the native structures of proteins from the knowledge of a structural profile â the first eigenvector of the contact map of the native structure itself. The procedure consists in carrying out Monte Carlo simulations of a tube model of the protein structure with an energy bias towards the target structural profile. We present the reconstruction of two small proteins and address problems arising in the reconstruction of larger proteins. Our results indicate that an accurate physico-chemical energy function should be used in conjunction with the structural profile bias in order to achieve accurate reconstructions.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Gene - Volume 422, Issues 1â2, 1 October 2008, Pages 47-51
Journal: Gene - Volume 422, Issues 1â2, 1 October 2008, Pages 47-51
نویسندگان
Katrin Wolff, Michele Vendruscolo, Markus Porto,