Diagnostic des anomalies chromosomiques par CGH array en pathologie constitutionnelle : la fin du caryotype en première intention

RésuméAujourd’hui, la CGH array a supplanté le caryotype pour l’étude globale du génome en offrant une résolution 10 à 500 fois supérieure et en donnant accès au contenu génique de la région remaniée. L’étude par cette technique des patients présentant une déficience intellectuelle et/ou des malformations congénitales a permis de détecter 10 à 15 % d’anomalies non visibles sur le caryotype. De plus, son utilisation élargie à d’autres indications a révélé des anomalies associées à des maladies neuropsychiatriques (telles que les troubles autistiques, la schizophrénie, les troubles bipolaires ou l’épilepsie isolée) et à des anomalies cardiaques, osseuses, rénales isolées ou autres. L’analyse des gènes présents dans le segment remanié afin d’établir le lien de causalité entre le déséquilibre génomique identifié et la pathologie observée est devenu l’aspect principal du travail du cytogénéticien. La CGH array s’affranchissant d’une analyse morphologique des chromosomes à l’inverse du caryotype offre l’avantage d’être une technique entièrement automatisable, ce qui permet une meilleure fiabilité et reproductibilité des résultats ainsi qu’une étude d’un plus grand nombre de patients. Elle est donc devenue aujourd’hui l’examen de première intention pour l’exploration du génome de nombreux patients.

Today, the array CGH has supplanted the karyotype for the global study of the genome with a resolution from 10 to 500 times better and with providing access to the genes content of the chromosomal rearrangement. The study of patients with intellectual disabilities and/or congenital malformations allowed to detect thanks to this technique 10 to 15% of abnormalities not visible on the karyotype. In addition, its use extended to other indications revealed anomalies associated with neuropsychiatric diseases (such as autism, schizophrenia, bipolar disorder or isolated epilepsy) and cardiac, bone, kidney or other isolated defects. The analysis of genes in the unbalanced chromosome segment to establish the causal link between the genomic imbalance identified and the pathology observed is at the core of the cytogeneticist's work. The array CGH freeing a morphological analysis of chromosomes of the karyotype in contrast, offers the advantage of being fully automated allowing improved reliability and reproducibility of the results and a study of more patients. Today, it has become the first-line test to explore the genome of many patients.