Análisis de las variaciones en el número de repeticiones de 5 marcadores ancestrales en donadores recurrentes en México

ResumenLos microsatélites son secuencias altamente polimórficas de ADN constituidas por repeticiones cortas regularmente de 1-7 pares de bases y con más del 70% de heterocigocidad. El objetivo del artículo fue obtener las frecuencias alélicas de 5 loci por electroforesis capilar y compararlas con la base de datos Combined DNA Index System (CODIS) para determinar la eficacia de la técnica en la determinación ancestral.Material y métodosSe extrajo el ADN de 50 individuos no relacionados (G1). Se amplificaron 6 loci mediante PCR. Se identificó la longitud de los marcadores por electroforesis capilar y las frecuencias se compararon con las reportadas en CODIS (G2) para población latina.ResultadosLas frecuencias de los polimorfismos TH01 y D2S1338 fueron las únicas similares a lo reportado en CODIS. El número de alelos del FGA fue distinto en ambos grupos, G1 no presentó 4 alelos reportados. El polimorfismo D18S51 en G1, presentó un alelo de 10.2 repeticiones no reportado en CODIS, y careció de 4 alelos. Para D16S539, los valores de nuestra población fueron distintos a los reportados, los alelos 7 y 17 presentes en nuestra población no están reportados en CODIS. Los alelos 14 y 15 reportados en CODIS no se observaron en nuestra población.ConclusionesEn la comparación de las frecuencias de los polimorfismos en una muestra de origen mestizo mexicana con otra población latina, las diferencias encontradas nos muestran la necesidad de crear bases de datos de referencia de nuestra población, teniendo en cuenta el mestizaje que nos caracteriza.

Microsatellites are highly polymorphic DNA sequences, consisting of short repeats, regularly from 1 to 7 base pairs, and over 70% of heterozygosity. The objective of this study was to obtain allele frequencies of 5 loci by capillary electrophoresis and comparing them with the Combined DNA Index System database (CODIS) to determine the effectiveness of the technique in the ancestral determination.Material and methodsDNA from 50 unrelated individuals (G1) was extracted. Six loci were amplified by PCR. The lengths of the markers were identified by capillary electrophoresis and the frequencies were compared with those reported in CODIS (G2) for Latin-Americans.ResultsThe frequencies of the polymorphisms, TH01 and D2S1338, were the only ones similar to those reported in CODIS. The number of alleles of FGA was different in both groups, and G1 did not have 4 of the reported alleles. The D18S51 polymorphism in G1 presented with a 10.2 allele unreported in CODIS, and lacked 4 alleles. For D16S539, our population values were different from those reported, 7 and 17 alleles were present in our population, but were not reported in CODIS. Moreover, alleles 14 and 15 reported in CODIS were not observed in our population.ConclusionsThe results of our study enable us to compare the frequencies of the polymorphisms in a sample of Mexican with other Latin Americans. The differences suggest the need to create databases of reference for our population, taking into account the race mixture that characterises us.