Viabilidad de las muestras ganglionares obtenidas por ecobroncoscopia para el estudio de alteraciones epigenéticas en pacientes con cáncer de pulmón

ResumenIntroducciónEl diagnóstico de la afectación metastásica ganglionar en el cáncer de pulmón constituye un problema, a pesar de los avances en la estadificación. La determinación del estado de metilación en ganglios podría mejorar la capacidad de las técnicas citohistológicas para detectar afectación metastásica. Nuestro objetivo fue demostrar la viabilidad de realizar estudios de metilación en muestras ganglionares citológicas.MétodosEstudio prospectivo que incluyó 88 pacientes con diagnóstico o alta sospecha de cáncer de pulmón no microcítico, en los que se realizó una punción citológica por ecobroncoscopia de adenopatías mediastínicas y/o hiliares. Se extrajo ADN a partir de muestras citológicas ganglionares y se realizó el tratamiento con bisulfito de sodio. Los estudios de metilación se realizaron por qPCR-MS y pirosecuenciación en los genes p16/INK4a y SHOX2.ResultadosLa metodología empleada permitió obtener ADN de características óptimas/buenas en el 90% de los casos. No se observaron diferencias en la concentración de ADN respecto a la estación ganglionar ni al diagnóstico final. Los análisis por qPCR-MS y pirosecuenciación no fueron posibles en un reducido número de muestras debido a baja concentración de ADN, además de la inadecuada pureza, fragmentación y/o degradación debido al tratamiento con bisulfito de sodio.ConclusiónLa cuantificación de la metilación por técnicas como qPCR-MS o pirosecuenciación en muestras ganglionares obtenidas por ecobroncoscopia resulta viable siempre y cuando se logre obtener una concentración adecuada de ADN, contribuyendo a la búsqueda de biomarcadores epigenéticos que mejoren la toma de decisiones en el cáncer de pulmón potencialmente curable en beneficio del paciente.

IntroductionThe diagnosis of microscopic lymph node metastasis in lung cancer is challenging despite the constant advances in tumor staging. The analysis of the methylation status of certain genes in lymph node samples could improve the diagnostic capability of conventional cyto-histological methods. The aim of this study was to demonstrate the feasibility of methylation studies using cytological lymph node samples.MethodsProspective study including 88 patients with a diagnosis or strong suspicion of non-small cell lung cancer, in which an echobronchoscopy was performed on mediastinal or hilar lymph nodes for diagnostic and/or staging. DNA was extracted from cytological lymph node samples and sodium bisulfite modification was performed. Methylation studies for p16/INK4a and SHOX2 were accomplished by MS-qPCR and pyrosequencing.ResultsThe methodology used in our study yielded optimal/good DNA quality in 90% of the cases. No differences in DNA concentration were observed with respect to the lymph node biopsied and final diagnosis. Methylation analyses using MS-qPCR and pyrosequencing were not possible in a small number of samples mainly due to low DNA concentration, inadequate purity, fragmentation and/or degradation as a consequence of bisulfite conversion.ConclusionMethylation quantification using MS-qPCR and pyrosequencing of cytological lymph node samples obtained using echobronchoscopy is feasible if an appropriate DNA concentration is obtained, notably contributing to the identification of epigenetic biomarkers capable of improving decision-making for the benefit of potentially curable lung cancer patients.