کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
5002917 1368459 2016 7 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Normalization of Western blot data affects the statistics of estimators*
ترجمه فارسی عنوان
عادی سازی داده های غربی بلاک بر آمار برآوردگرها تاثیر می گذارد *
کلمات کلیدی
ترجمه چکیده
این مطالعه در مورد عادی سازی داده ها از آزمایشات غربی و اثرات آن بر برآورد پارامتر توضیح می دهد. داده های غربی باید به طور مناسب قبل از پردازش شوند تا بتوان مقایسه را در تکرارهای مختلف انجام داد. این شامل یک روش عادی سازی دو مرحله ای است که در آن سیگنال های خام به یک کنترل بارگیری و به علاوه یک وضعیت مرجع نرمال می شوند. اگر سیگنالها به طور معمول توزیع شوند، داده های نرمال شده با نسبت توزیع های نرمال توصیف می شوند که دارای برخی از ویژگی های خاص است که می تواند تجزیه و تحلیل های بیشتر مانند تخمین پارامتر برای بازسازی شبکه بیوشیمیایی را پیچیده کند. در اینجا ما برخی از ویژگی های این توزیع نسبت و شرایط تقریبی های مختلفی را ارائه می دهیم که تجزیه و تحلیل های بیشتری را تسهیل می کنند. ما نتایج یک مطالعه موردی را نشان می دهیم که در آن داده های غربی مورد استفاده قرار می گیرد تا نتیجه تغییرات در یک آزمایش نابودی را به دست آورد.
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه سایر رشته های مهندسی مکانیک محاسباتی
چکیده انگلیسی
This study elaborates on the normalization of data from Western blot experiments and its impact on parameter estimation. Western blot data have to be preprocessed appropriately in order to enable comparison across different replicates. This includes a two step normalization procedure, in which the raw signals are normalized to a loading control and additionally to a reference condition. If the signals themselves are normally distributed, the normalized data are described by ratios of normal distributions, which have some peculiarities that can complicate further analysis such as parameter estimation for biochemical network reconstruction. Here we shortly recapitulate some properties of these ratio distributions and conditions for various approximations that facilitate further analysis. We illustrate results on a case study in which Western blot data are used to infer the fold change in a knockdown experiment.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: IFAC-PapersOnLine - Volume 49, Issue 26, 2016, Pages 56-62
نویسندگان
, ,