کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
5103339 | 1480104 | 2017 | 5 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Hidden thermodynamic information in protein amino acid mutation tables
ترجمه فارسی عنوان
اطلاعات ترمودینامیکی مخفی در جداول جهش آمینو اسید پروتئین
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه
ریاضیات
فیزیک ریاضی
چکیده انگلیسی
We combine the standard 1992 20Ã20 substitution matrix based on block alignment, BLOSUM62, with the standard 1982 amino acid hydropathicity scale KD as well as the modern 2007 hydropathicity scale MZ, and compare the results. The 20-parameter KD and MZ hydropathicity scales have different thermodynamic character, corresponding to first- and second-order transitions. The KD and MZ comparisons show that the mutation rates reflect quantitative iteration of qualitative amino acid-phobic and -philic binary 2Ã10 properties that define quaternary 4Ã5 subgroups (but not quinary 5Ã4 subgroups), with the modern MZ bioinformatic scale giving much better results. The quaternary 5-mer MZ 4Ã5 subgroups are called mutons (Mu5). Among all hydropathicity scales, the MZ scale uniquely exhibits a smooth, deep mutational minimum at its center associated with alanine, glycine, the smallest amino acid, and histidine.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Physica A: Statistical Mechanics and its Applications - Volume 469, 1 March 2017, Pages 676-680
Journal: Physica A: Statistical Mechanics and its Applications - Volume 469, 1 March 2017, Pages 676-680
نویسندگان
J.C. Phillips,