کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
5541887 1402512 2017 16 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Invited review: Inbreeding in the genomics era: Inbreeding, inbreeding depression, and management of genomic variability
ترجمه فارسی عنوان
بررسی دعوت شده: تداخل در دوران ژنومیک: درختکاری، افسردگی درونی و مدیریت تغییرات ژنتیکی
کلمات کلیدی
ترجمه چکیده
به طور سنتی، ضریب های رابطه ای مبتنی بر شجره نامه برای مدیریت درختکاری و درجه افسردگی درونی که در یک جمعیت وجود دارد استفاده شده است. ترکیب گسترده اطلاعات ژنتیکی در ارزیابی ژنتیکی دام های گاو اجازه می دهد تا فرصتی برای توسعه و پیاده سازی روش های مدیریت جمعیت در سطح ژنوم فراهم کند. در نتیجه، به نسبت استفاده از اطلاعات شجره ای برای برآورد نسبت مورد انتظار از آلل های مشترک، نسبت تقریبا متوجه ژنوم که 2 نفر به اشتراک می گذارند، می توانند با دقت برآورد شوند. علاوه بر این، اطلاعات ژنتیکی اجازه می دهد تا بر اساس محاسبات ژنوم یا برهم کنش های درختی، ارتباطات را برای مناطق خاص ژنوم مشخص کنیم. کشش های منطقه ای می تواند به طور موثر مدیریت مناطقی از تنوع ژنتیکی کم و یا مناطقی که هنگام هوموزیگوت باعث کاهش عملکرد در صفات اقتصادی مهم می شود. استفاده از معیارهای خاص منطقه باید اجازه دهد تا پرورش دهندگان دقیق تر از بین بردن ارزش ژنتیکی نسلی و عوارض جانبی ناخواسته مرتبط با درخت زدن مدیریت را مدیریت کنند. با این حال، هنوز هم نیاز به توسعه دارد، روش هایی که به منظور شناسایی بهتر مناطق تحت تاثیر کشت و ساز و استفاده از آنها برای مدیریت ژنوم در سطح گله مناسب است. ما موضوعات مرتبط با کشت، اندازه گیری وابستگی، تنوع ژنتیکی و روش های مدیریت جمعیت در سطح ژنوم را مورد بررسی قرار داده ایم و ما در مورد چالش های آینده مربوط به مدیریت جمعیت از طریق اجرای روش های ژنتیکی در میزان گله و جمعیت مورد بحث قرار گرفته ایم.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری علوم کشاورزی و بیولوژیک علوم دامی و جانورشناسی
چکیده انگلیسی
Traditionally, pedigree-based relationship coefficients have been used to manage the inbreeding and degree of inbreeding depression that exists within a population. The widespread incorporation of genomic information in dairy cattle genetic evaluations allows for the opportunity to develop and implement methods to manage populations at the genomic level. As a result, the realized proportion of the genome that 2 individuals share can be more accurately estimated instead of using pedigree information to estimate the expected proportion of shared alleles. Furthermore, genomic information allows genome-wide relationship or inbreeding estimates to be augmented to characterize relationships for specific regions of the genome. Region-specific stretches can be used to more effectively manage areas of low genetic diversity or areas that, when homozygous, result in reduced performance across economically important traits. The use of region-specific metrics should allow breeders to more precisely manage the trade-off between the genetic value of the progeny and undesirable side effects associated with inbreeding. Methods tailored toward more effectively identifying regions affected by inbreeding and their associated use to manage the genome at the herd level, however, still need to be developed. We have reviewed topics related to inbreeding, measures of relatedness, genetic diversity and methods to manage populations at the genomic level, and we discuss future challenges related to managing populations through implementing genomic methods at the herd and population levels.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Dairy Science - Volume 100, Issue 8, August 2017, Pages 6009-6024
نویسندگان
, , , ,