Using large-scale genome variation cohorts to decipher the molecular mechanism of cancer

Caractériser les variations structurelles génomiques (SVs) dans le génome humain reste difficile et comprendre ces variations somatiques survenant dans le cancer, une maladie du génome, fait l'objet d'un intérêt croissant. Un processus de SV ravageur, connu sous le nom de chromothripsie, endommage le génome par un phénomène de fragmentation-réparation localisé en une seule étape, qui devient soudainement catastrophique. Des efforts récents ont conduit à l'élaboration d'un ensemble de critères conceptuels pour révéler des événements de chromothripsie dans les cancers et pour développer des systèmes modèles expérimentaux pour étudier in vitro ce processus d'altération de l'ADN. Nous discuterons ces approches et de plus, nous évoquerons les efforts actuels qui, mettant en œuvre des ressources informatiques à l'échelle mondiale de type « Big Data » sur de nombreux génomes, recherchent des points communs et des différences dans les processus d'altération moléculaire de l'ADN dans le cancer.