کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
5589422 | 1569813 | 2017 | 15 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Pan-genome analysis of Clostridium botulinum reveals unique targets for drug development
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
Clusters of Orthologous Groups of proteinsSingletonsROCNCBIORFC. botulinumCoGPSSMSyntenySWGMLSTATCCHspPSI-BLAST - PSI BLASTPosition-Specific Iterated BLAST - انحراف موضعی خاصMulti locus sequence typing - تایپ توالی توالی چندگانهGenomic islands - جزایر ژنومیKEGG یا Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes - دایرة المعارف ژن ها و ژنوم کیوتو World Health Organization - سازمان بهداشت جهانیPhylogenomic - فیلوژنومیکopen reading frame - قاب خواندن بازPosition specific scoring matrix - ماتریس نمره دهی خاص را بگذاریدSVM - ماشین بردار پشتیبانیSupport vector machine - ماشین بردار پشتیبانیAmerican Type Culture Collection - مجموعه فرهنگی نوع آمریکاییResistome - مقاومتreceiver operating curve - منحنی عامل گیرندهClostridium botulinum - کلستریدیوم بوتولینومWHO - که
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
ژنتیک
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
Clostridium botulinum, a formidable pathogen is responsible for the emerging cause of food poisoning cases on the global canvas. The endemicity of bacterium Clostridium botulinum is reflected by the sudden hospital outbreaks and increased resistance towards multiple drugs. Therefore, a combined approach of in-silico comparative genomic analysis with statistical analysis was applied to overcome the limitation of bench-top technologies. Owing to the paucity of genomic data available by the advent of third generation sequencing technologies, several 'omics' technologies were applied to understand the underlying evolutionary pattern and lifestyle of the bacterial pathogen using phylogenomics. The calculation of pan-genome, core genome and singletons provides view of genetic repertoire of the bacterial pathogen lineage at the successive level, orthology shared and specific gene subsets. In addition, assessment of pathogenomic potential, resistome, toxin/antitoxin family in successive pathogenic strains of Clostridium botulinum aids in revealing more specific targets for drug design and development.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Gene - Volume 623, 5 August 2017, Pages 48-62
Journal: Gene - Volume 623, 5 August 2017, Pages 48-62
نویسندگان
Tulika Bhardwaj, Pallavi Somvanshi,