کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
5589509 | 1569800 | 2017 | 40 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Single cell transcriptome analysis of muscle satellite cells reveals widespread transcriptional heterogeneity
ترجمه فارسی عنوان
تجزیه و تحلیل تک سلولی ترانسکتروموم سلول های ماهواره ای عضلانی نشان می دهد ناهمگونی رونویسی گسترده
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
NMFHSPGFPKMscRNA-seqsingle cell RNA sequencingPCA - PCAPrincipal component analysis - تحلیل مولفههای اصلی یا PCATranscriptome - ترانسکریپتومNon-negative matrix factorization - تقسیم ماتریس غیر منفیSingle cell - سلول تکSatellite cell - سلول ماهواره ایMuscle stem cell - سلول های بنیادی عضلهFragments per kilobase of transcript per million mapped reads - قطعه در هر کیلو بایت رونویسی در هر میلیون نقشه برداری شده استHeterogeneity - ناهمگونیHeparan sulfate proteoglycan - هپارین سولفات پروتئگلیکانRNA binding protein - پروتئین متصل به RNA
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
ژنتیک
چکیده انگلیسی
Tissue specific stem cells are indispensable contributors to adult tissue maintenance, repair, and regeneration. In skeletal muscle, satellite cells (SCs) are the resident muscle stem cell population and are required to maintain skeletal muscle homeostasis throughout life. Increasing evidence suggests that SCs are a heterogeneous cell population with substantial biochemical and functional diversity. A major limitation in the field is an incomplete understanding of the nature and extent of this cellular heterogeneity. Single cell analyses are well suited to addressing this issue, especially when coupled to unbiased profiling paradigms such as high throughout RNA sequencing. We performed single cell RNA sequencing (scRNA-seq) on freshly isolated muscle satellite cells and found a surprising degree of heterogeneity at multiple levels, from muscle-specific transcripts to the broader SC transcriptome. We leveraged several comparative bioinformatics techniques and found that individual SCs enrich for unique transcript clusters. We propose that these gene expression “fingerprints” may contribute to observed functional SC diversity. Overall, these studies underscore the importance of several established SC signaling pathways/processes on a single cell level, implicate novel regulators of SC heterogeneity, and lay the groundwork for further investigation into SC heterogeneity in health and disease.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Gene - Volume 636, 15 December 2017, Pages 54-63
Journal: Gene - Volume 636, 15 December 2017, Pages 54-63
نویسندگان
Dong Seong Cho, Jason D. Doles,