کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
5589641 | 1569809 | 2017 | 36 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Mitochondrial genome of Helice tientsinensis (Brachyura: Grapsoidea: Varunidae): Gene rearrangements and higher-level phylogeny of the Brachyura
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
atp8mt genomenad4LrrnSPCGsRSCUatp6rrnLBPPamino acid - آمینو اسیدBayesian posterior probability - احتمال خلفی بیزیRelative Synonymous Codon Usage - استفاده کادون مترادف نسبیGene rearrangements - بازسازی ژنphylogenetic analysis - تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکBayesian inference - تخمین بیزین یا استنباط بیزیMaximum likelihood - حداکثر احتمالCytochrome b - سیتوکروم بControl region - منطقه کنترلprotein coding genes - ژن های کد کننده پروتئینMitochondrial genome - ژنوم میتوکندریابیMitochondrial genomes - ژنوم های میتوکندریcob - کوب
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
ژنتیک
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
The mitochondrial genome (mt genome) provides important information for understanding molecular evolution and phylogeny. The further understand the molecular evolution and phylogeny of Helice tientsinensis, the complete mt genome was determined. It is 16,212 bp long and includes 13 protein-coding genes (PCGs), 22 tRNA genes, two rRNA genes and a control region. The genome composition of H. tientsinensis was highly A + T biased 69.0% and showed negative AT skew (â 0.017) and GC skew (â 0.289). One PCG, all rRNAs and 12 of the tRNAs appeared to be rearranged with respect to the pancrustacean ground pattern gene order. Tandem duplication, followed by random deletion, is widely considered to explain translocation of mitochondrial genes. Consecutive recombinations events could explain inversions of genes. The phylogenetic analyses showed that H. tientsinensis has close relationships with Eriocheir japonica sinensis, E. j. hepuensis and E. j. japonica; this indicated that H. tientsinensis belongs in the Grapsoidea, part of the Varunidae family. This study provides evidence for a better understanding of gene rearrangements, as well as the evolutionary status of H. tientsinensis and related species.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Gene - Volume 627, 5 September 2017, Pages 307-314
Journal: Gene - Volume 627, 5 September 2017, Pages 307-314
نویسندگان
Zhao-Zhe Xin, Yu-Liu Yu-Liu, Dai-Zhen Zhang, Zheng-Fei Wang, Hua-Bin Zhang, Bo-Ping Tang, Chun-Lin Zhou, Xin-Yue Chai, Qiu-Ning Liu,