کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
5589902 | 1569838 | 2017 | 31 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Characterization of complete mitochondrial genome of fives tripe wrasse (Thalassoma quinquevittatum, Lay & Bennett, 1839) and phylogenetic analysis
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
PCGsapocytochrome bCytochrome c oxidase subunits I–IIIATPase subunits 6 and 8rRNAND1–ND6 and ND4LD-loop regionKa/KstRNAcytBatp6 and atp8 - atp6 و atp8Mitochondrial DNA - DNA میتوکندریاRibosomal RNA - RNA Ribosomaltransfer RNA - انتقال RNAphylogenetic analysis - تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکBayesian inference - تخمین بیزین یا استنباط بیزیMaximum likelihood - حداکثر احتمالMaximum parsimony - حداکثر پارسیمونیNADH dehydrogenase subunits 1–6 and 4L - زیربخشهای NADH dehydrogenase 1-6 و 4LProtein-coding genes - ژن های کد گذاری پروتئین
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
ژنتیک
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
To further supplement the genome-level features in related species, T. quinquevittatum complete mtDNA was firstly sequenced and de novo assembled by next-generation sequencing. The full-length mtDNA of T. quinquevittatum was a 16,896Â bp fragment, which was atypical of Labridae, with 2 ribosomal RNA (rRNA) genes, 13 protein-coding genes (PCGs), 23 transfer RNA (tRNA) genes, and a major non-coding control region (D-loop region). Additionally, the mtDNA of T. quinquevittatum exhibited characteristics of A (27.1%), T (29.3%), G (17.8%), and C (25.8%) with a high AÂ +Â T content (56.4%). Furthermore, the analysis of the average Ka/Ks in the 13 PCGs of three Labridae species indicated a strong purifying selection within this group. Additionally, the phylogenetic analysis based on 13 concatenated PCGs nucleotide and amino acid datasets, showed high value support for the following sister clade among the four genera (T. quinquevittatum, Halichoeres trimaculatus, Halichoeres melanurus, Parajulis poecilepterus). The complete mtDNA of the T. quinquevittatum provided important information for the study in population genetics and evolutionary theory.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Gene - Volume 598, 20 January 2017, Pages 71-78
Journal: Gene - Volume 598, 20 January 2017, Pages 71-78
نویسندگان
Kecheng Zhu, Na Wu, Xiaoxiao Sun, Huayang Guo, Nan Zhang, Shigui Jiang, Dianchang Zhang,