کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
5591601 | 1404985 | 2017 | 14 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Helical reconstruction in RELION
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
FSCTMVMAVSIHRSRIterative helical real-space reconstruction - بازسازی واقعی فضایی هلیکوپترSingle-particle analysis - تجزیه و تحلیل تک ذراتHelical symmetry - تقارن هلالیcaspase activation and recruitment domain - فعال سازی caspase و دامنه استخدامElectron microscopy - میکروسکوپ الکترونیCryo-electron microscopy - میکروسکوپ الکترونی کرایوFourier shell correlation - همبستگی پوسته فوریهTobacco mosaic virus - ویروس موزائیک توتونImage processing - پردازش تصویرmitochondrial antiviral signaling protein - پروتئین سیگنالینگ ضد ویروسی میتوکندریCARD - کارت
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
زیست شناسی مولکولی
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
We describe a new implementation for the reconstruction of helical assemblies in the empirical Bayesian framework of RELION. Our approach calculates optimal linear filters for the 3D reconstruction by embedding helical symmetry operators in Fourier-space, and deals with deviations from perfect helical symmetry through Gaussian-shaped priors on the orientations of individual segments. By incorporating our approach into the standard pipeline for single-particle analysis in RELION, our implementation aims to be easily accessible for non-experienced users. Although our implementation does not solve the problem that grossly incorrect structures can be obtained when the wrong helical symmetry is imposed, we show for four different test cases that it is capable of reconstructing structures to near-atomic resolution.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Structural Biology - Volume 198, Issue 3, June 2017, Pages 163-176
Journal: Journal of Structural Biology - Volume 198, Issue 3, June 2017, Pages 163-176
نویسندگان
Shaoda He, Sjors H.W. Scheres,