کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
5760132 | 1623791 | 2017 | 25 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
From typical sequences to typical genotypes
ترجمه فارسی عنوان
از توالی های معمولی تا ژنوتیپ های معمولی
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
توالی های معمولی، ژنوتایپ های معمولی، نرخ آنتروپی جمعیت، جمعیت تقاطع آنتروپی، طبقه بندی،
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
علوم کشاورزی و بیولوژیک
علوم کشاورزی و بیولوژیک (عمومی)
چکیده انگلیسی
We demonstrate an application of a core notion of information theory, typical sequences and their related properties, to analysis of population genetic data. Based on the asymptotic equipartition property (AEP) for nonstationary discrete-time sources producing independent symbols, we introduce the concepts of typical genotypes and population entropy and cross entropy rate. We analyze three perspectives on typical genotypes: a set perspective on the interplay of typical sets of genotypes from two populations, a geometric perspective on their structure in high dimensional space, and a statistical learning perspective on the prospects of constructing typical-set based classifiers. In particular, we show that such classifiers have a surprising resilience to noise originating from small population samples, and highlight the potential for further links between inference and communication.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Theoretical Biology - Volume 419, 21 April 2017, Pages 159-183
Journal: Journal of Theoretical Biology - Volume 419, 21 April 2017, Pages 159-183
نویسندگان
Omri Tal, Tat Dat Tran, Jacobus Portegies,