کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
5793892 1554183 2013 9 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Retrospective time series analysis of veterinary laboratory data: Preparing a historical baseline for cluster detection in syndromic surveillance
ترجمه فارسی عنوان
تجزیه و تحلیل سری های زمان بندی مجدد داده های آزمایشی دامپزشکی: تهیه پیشینه تاریخی برای تشخیص خوشه در نظارت سندرمی
کلمات کلیدی
تجزیه و تحلیل سریال، تجزیه و تحلیل مجدد، آزمایشگاه، نظارت سندرمی، روند بیماری، نظارت بر بهداشت حیوانات،
ترجمه چکیده
نظارت بر بیماری در دو دهه گذشته به سمت معرفی سیستم هایی که قادر به تشخیص زودهنگام بیماری است، تغییر کرده است. سیستم های بیولوژیک مدرن مدرن منابع مختلفی از داده های پیش تشخیصی مانند شکایت اصلی بیمار در مورد بازدید اورژانس یا سفارش آزمایش آزمایشگاه را مورد بررسی قرار می دهند. این منابع داده ها می توانند تشخیص سریعتری نسبت به نظارت سنتی بر اساس تایید پرونده فراهم کنند، اما کمتر مشخص هستند و بنابراین استفاده از آنها چالش های مربوط به وجود سر و صدای پس زمینه و انحرافات موقتی بدون برچسب در داده های تاریخی را نشان می دهد. هدف کلی این مطالعه، انجام تجزیه و تحلیل گذشته نگر با استفاده از سه سال آزمایش آزمایشگاه آزمایشگاه آزمایشگاه بهداشت حیوانات در استان انتاریو، کانادا، برای تهیه داده ها برای استفاده در نظارت سندرمی است. موارد روزانه به سندرم تقسیم شدند و شمارش برای هر سندرم روزانه انجام شد، زمانی که میانیان بالاتر از یک مورد در روز بود و هر هفته در غیر این صورت. حسابرسی ریسک پواسون برای روزهای هفته و ماه توانسته است اثر روزانه را با حداقل تاثیر بر انحرافات زمانی مواجه کند. با استفاده از رگرسیون پوآسون به روش تکراری، که داده ها را بالاتر از درصد پیش بینی شده 95 درصد از تعداد روزانه، حذف کردن این انحرافات در غیاب شکاف های برچسب دار با حفظ اثر روزانه هفته ای که در اصل داده ها. این منجر به ساخت سری زمانی شد که نشانگر الگوهای پایه در طی سه سال گذشته بود، بدون انحرافات زمانی. بدین ترتیب، روش نهایی قادر به حذف حوادث زمانی بود در حالی که اثرات اصلی قابل توضیح در داده ها را حفظ می کرد، نیازی به یک دوره آموزشی بدون رعایت نکردن داشت، حداقل به آبراهایی که در داده های خام وجود داشت، تعدیل می کرد و نیازی به بروز علائم برچسب دار نبود. علاوه بر این، آن را به راحتی قابل دسترسی بود برای داده های هفتگی با جایگزینی رگرسیون پوآسون با حرکت صدک 95.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری علوم کشاورزی و بیولوژیک علوم دامی و جانورشناسی
چکیده انگلیسی
The practice of disease surveillance has shifted in the last two decades towards the introduction of systems capable of early detection of disease. Modern biosurveillance systems explore different sources of pre-diagnostic data, such as patient's chief complaint upon emergency visit or laboratory test orders. These sources of data can provide more rapid detection than traditional surveillance based on case confirmation, but are less specific, and therefore their use poses challenges related to the presence of background noise and unlabelled temporal aberrations in historical data. The overall goal of this study was to carry out retrospective analysis using three years of laboratory test submissions to the Animal Health Laboratory in the province of Ontario, Canada, in order to prepare the data for use in syndromic surveillance. Daily cases were grouped into syndromes and counts for each syndrome were monitored on a daily basis when medians were higher than one case per day, and weekly otherwise. Poisson regression accounting for day-of-week and month was able to capture the day-of-week effect with minimal influence from temporal aberrations. Applying Poisson regression in an iterative manner, that removed data points above the predicted 95th percentile of daily counts, allowed for the removal of these aberrations in the absence of labelled outbreaks, while maintaining the day-of-week effect that was present in the original data. This resulted in the construction of time series that represent the baseline patterns over the past three years, free of temporal aberrations. The final method was thus able to remove temporal aberrations while keeping the original explainable effects in the data, did not need a training period free of aberrations, had minimal adjustment to the aberrations present in the raw data, and did not require labelled outbreaks. Moreover, it was readily applicable to the weekly data by substituting Poisson regression with moving 95th percentiles.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Preventive Veterinary Medicine - Volume 109, Issues 3–4, 1 May 2013, Pages 219-227
نویسندگان
, , , , , ,