کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
5913838 | 1162704 | 2015 | 13 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Visualization and quality assessment of the contrast transfer function estimation
ترجمه فارسی عنوان
تجسم و ارزیابی کیفی تخمین عملکرد انتقال کنتراست
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
CCDFSCPSDDDDCTFFBC3DEMSTIVcontrast transfer function - تابع انتقال کنتراستpower spectrum density - تراکم طیف توانdirect detection device - دستگاه تشخیص مستقیمCharge-Coupled Device - دستگاه متصل شارژThree-dimensional electron microscopy - میکروسکوپ الکترونی سه بعدیTransmission electron microscopy - میکروسکوپ الکترونی عبوریFourier shell correlation - همبستگی پوسته فوریهComputer-assisted image processing - پردازش تصویر با کمک کامپیوتر
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
زیست شناسی مولکولی
چکیده انگلیسی
The contrast transfer function (CTF) describes an undesirable distortion of image data from a transmission electron microscope. Many users of full-featured processing packages are often new to electron microscopy and are unfamiliar with the CTF concept. Here we present a common graphical output to clearly demonstrate the CTF fit quality independent of estimation software. Separately, many software programs exist to estimate the four CTF parameters, but their results are difficult to compare across multiple runs and it is all but impossible to select the best parameters to use for further processing. A new measurement is presented based on the correlation falloff of the calculated CTF oscillations against the normalized oscillating signal of the data, called the CTF resolution. It was devised to provide a robust numerical quality metric of every CTF estimation for high-throughput screening of micrographs and to select the best parameters for each micrograph. These new CTF visualizations and quantitative measures will help users better assess the quality of their CTF parameters and provide a mechanism to choose the best CTF tool for their data.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Structural Biology - Volume 192, Issue 2, November 2015, Pages 222-234
Journal: Journal of Structural Biology - Volume 192, Issue 2, November 2015, Pages 222-234
نویسندگان
Lisa K. Sheth, Angela L. Piotrowski, Neil R. Voss,