کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
6368804 1623798 2017 22 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
An approach to expand description of the pump and co-transporter steady-state current
ترجمه فارسی عنوان
یک رویکرد برای گسترش توضیح جریان پیمان پمپ و هماهنگ کننده
ترجمه چکیده
انتقال دهنده های غشاء (پمپ ها و وسایل نقلیه) بازیکنان اصلی در حفظ هومیوستاز سلول هستند. مدل های انواع مختلف، هر کدام با اشکالات خود، رفتار حمل و نقل را توصیف می کنند. هدف این مطالعه یافتن پیوند بین مدل های مبتنی بر بیوفیزیکی و تجربی برای مقابله با مشکلات خاص خود است. به جای کاهش تعداد حالت ها و استفاده از چند ثابت ثابت پیچیده به طور معمول انجام می شود، ما از تعداد دولت ها به عنوان بزرگ که ممکن است استفاده می کنیم. سپس، هر انتقال در چرخه می تواند یک فرایند ابتدایی نشان و ما می توانیم از قانون کنش توده اعمال می شود، که بر طبق آن اگر ثابت های سرعت بر غلظت وابستگی خطی است بستگی دارد. بنابراین، بیان جریان کنترلی حالت ثابت می تواند از یک تابع ثابت ثابت به یک تابع غلظت تبدیل شود. هنگامی که دولت های حمل و نقل یک چرخه واحد را تشکیل می دهند، می توان آن را با دو حالت عمل - رو به جلو و عقب نشان داد. حالت خاصی بسته به انرژی آزاد در دسترس است. هر حالت عمل با مجموعه ای از وابستگی های حمل کننده همراه با یک پارامتر که حداکثر سرعت چرخش را توصیف می کند مشخص می شود. به استثنای وابستگی های استاندارد مربوط به مواد مرتبط با حمل کننده، تعاریف مربوط به مواد آزاد شده نیز تعریف شده است. چنین طرح ایده هایی را برای ایجاد تقریبی فراهم می کند، به این ترتیب که هر فرد می تواند از آزمایشات به عنوان دقیق ترین حد ممکن محاسبه شود. تقریب ممکن است نه تنها برای توضیحات و مطالعه فعلی حمل و نقل، بلکه در مدل های تلفن همراه است که تلاش برای توصیف طیف گسترده ای از فرآیندها در سلولهای تحریکی استفاده می شود.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری علوم کشاورزی و بیولوژیک علوم کشاورزی و بیولوژیک (عمومی)
چکیده انگلیسی
The membrane transporters (pumps and co-transporters) are the main players in maintaining the cell homeostasis. Models of various types, each with their own drawbacks, describe transporter behavior. The aim of this study is to find the link between the biophysically based and empirical models to face and solve their specific problems. Instead of decreasing the number of states and using few complex rate constants as is usually done, we use the number of states as great as possible. Then, each transition in the cycle can represent an elementary process and we can apply the mass action law, according to which if rate constants depend on concentrations the dependence is linear. Thus, the expression for the steady state transporter current can be transformed from a function of rate constants into a function of concentrations. When transporter states form a single cycle, it can be characterized by two modes of action - forward and backward ones. Specific mode is realized depending on the available free energy. Each mode of action is characterized by a set of transporter affinities together with a parameter that describes the maximal turning rate. Except standard affinities corresponding to the substances that are binding to the transporter, affinities for the substances that are released are also defined. Such scheme provides great possibilities to construct approximations as each individual affinity could be estimated from experiments as precisely as possible. The approximations may be used for not only description and study of the transporter current but also in cellular models that attempt to describe wide variety of processes in excitable cells.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Theoretical Biology - Volume 412, 7 January 2017, Pages 94-99
نویسندگان
,