کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
6369187 1623809 2016 13 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Analysis of single particle diffusion with transient binding using particle filtering
ترجمه فارسی عنوان
تجزیه و تحلیل انتشار تک ذرات با اتصال گذرا با فیلتر کردن ذرات
کلمات کلیدی
مدل سوئیچینگ، ردیابی ذرات، فیلتر ذرات،
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری علوم کشاورزی و بیولوژیک علوم کشاورزی و بیولوژیک (عمومی)
چکیده انگلیسی
Diffusion with transient binding occurs in a variety of biophysical processes, including movement of transmembrane proteins, T cell adhesion, and caging in colloidal fluids. We model diffusion with transient binding as a Brownian particle undergoing Markovian switching between free diffusion when unbound and diffusion in a quadratic potential centered around a binding site when bound. Assuming the binding site is the last position of the particle in the unbound state and Gaussian observational error obscures the true position of the particle, we use particle filtering to predict when the particle is bound and to locate the binding sites. Maximum likelihood estimators of diffusion coefficients, state transition probabilities, and the spring constant in the bound state are computed with a stochastic Expectation-Maximization (EM) algorithm.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Theoretical Biology - Volume 401, 21 July 2016, Pages 109-121
نویسندگان
, ,