Revisiting the time until fixation of a neutral mutant in a finite population - A coalescent theory approach

ارزیابی مقیاس زمانی ثابت شدن جهش های خنثی در درک نظری نقش جهش های خنثی در تکامل حیاتی است. تقریبهای تقریبی مدل رایت-فیشر اغلب برای استخراج فرمولاسیونهای تحلیلی از ریزش ژنتیکی و نیز برای مقیاسهای زمان ثابت شدن موتاسیون های خنثی استفاده می شود. این تقریبها نیازمند مجموعه ای از مفروضات هستند، به ویژه اینکه راندگی ژنتیکی یک فرآیند تصادفی در فضای فرکانسی آلل است که یک فرض مناسب برای جمعیت های بزرگ است. در اینجا، تقریب های معادل با استفاده از یک رویکرد تئوری کوالسست که بر مجموعه ای متفاوت از فرضیات از رویکرد انتشار تکیه می کند، و یک فضای فرکانسی آلل گسسته اتخاذ می شود. راه حل های برای میانگین و واریانس زمان برای ثابت شدن یک جهش بی طرف مشتق شده از دو روش برای جمعیت های بزرگ همگرایی است، اما کمی برای جمعیت های کوچک متفاوت است. تجزیه و تحلیل زنجیره مارکوف از مدل رایت فیشر برای جمعیت های کوچک برای ارزیابی راه حل های به دست آمده استفاده شده است، نشان می دهد که هر دو میانگین و واریانس بهتر از روش همبستگی تقریب می یابند. تقریب کوئلانسس نشان دهنده یک مرز قائلی بالاتر از متوسط ​​زمان برای ثابت شدن نسبت به تقریب انتشار است، در حالی که تقریب نفوذ و تقسیم جمع شدن به ترتیب برای واریانس تشکیل شده اند. راه حل های همگرا و انحرافات کوچک این دو رویکرد به شدت اعتبار استفاده از تقریبهای انتشار را نشان می دهند، اما پیشنهاد می کنند که تئوری کوالسسیت می تواند تقریبی دقیق تر را برای جمعیت های کوچک فراهم کند.