Protein sequence complexity revisited. Relationship with fractal 3D structure, topological and kinetic parameters

مطالعه پیچیدگی دنباله پروتئین یک منطقه جدید نیست و روش های روش شناسی متعددی برای توصیف یا نشان دادن اطلاعات پروتئین پروتئین موجود است. در این تحقیق رابطه بین پیچیدگی توالی و ابعاد فراکتال ساختاری، اطلاعات ساختاری ثانویه، تعداد دامنه ها و همچنین پارامترهای سینتیکی با استفاده از روش های مختلف مورد بررسی قرار گرفت. نتایج ما نشان می دهد که برخی از شاخص های پیچیدگی دنباله به اندازه کافی حساس هستند تا تمایز بومی از توالی های تصادفی، حتی زمانی که تفاوت ها کوچک باشند. همچنین ما دریافتیم که پروتئین هایی با پیچیدگی بیشتر، تعداد بیشتری از دامنه ها، طول افزایش و دسترسی به میزان حلال را ارائه می دهند. افزون بر این، پروتئین هایی با پیچیدگی کم نشان داد که میزان ثابت و غیرقطعی افزایش یافته است. جالب توجه است، ما پیوسته بین پیچیدگی دنباله پروتئین و بعد فرکتال ساختاری و اثر قابل توجهی از کلاس های ساختار ثانویه پیدا کردیم.