کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
8038092 1518323 2015 7 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Accurate membrane tracing in three-dimensional reconstructions from electron cryotomography data
ترجمه فارسی عنوان
ردیابی دقیق غشا در بازسازی های سه بعدی از داده های کریوتوگرام الکترون
کلمات کلیدی
توموگرافی الکترونی، کریو، پردازش تصویر، تشخیص غشاء، استخراج ویژگی،
ترجمه چکیده
ارتباط بین ماتریس خارج سلولی و سلول مهم است برای مکانیک انتقال و مکانیکولوژی. گریو توموگرافی الکترون عموما بهتر از تجزیه و تحلیل نانومتر از این اتصالات است، اما محدودیت های هندسه جمع آوری داده ها مانع از استخراج دقیق محل غشاء شکمی از این توموگرافی ها، یک پیش نیاز ضروری برای تجزیه و تحلیل است. در اینجا، ما یک راهبرد جدید ردیابی غشائی را معرفی می کنیم که امکان استخراج غشاء وینتر را با وفاداری بالا و دقت فوق العاده ای فراهم می کند. رویکرد مبتنی بر شناسایی مرز بین داخل و خارج از سلول است تا اینکه تلاش شود به صراحت از غشاء ردیابی شود. مطالعات شبیه سازی نشان می دهد که بیش از 99 درصد از غشا را می توان به درستی با استفاده از این اصل مدل سازی کرد و مطابقت خوبی از کشش غشاء بصری با مرز استخراج داده های تجربی نشان می دهد که دقت برای داده های واقعی قابل مقایسه است.
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه مهندسی مواد فناوری نانو (نانو تکنولوژی)
چکیده انگلیسی
The connection between the extracellular matrix and the cell is of major importance for mechanotransduction and mechanobiology. Electron cryo-tomography, in principle, enables better than nanometer-resolution analysis of these connections, but restrictions of data collection geometry hamper the accurate extraction of the ventral membrane location from these tomograms, an essential prerequisite for the analysis. Here, we introduce a novel membrane tracing strategy that enables ventral membrane extraction at high fidelity and extraordinary accuracy. The approach is based on detecting the boundary between the inside and the outside of the cell rather than trying to explicitly trace the membrane. Simulation studies show that over 99% of the membrane can be correctly modeled using this principle and the excellent match of visually identifiable membrane stretches with the extracted boundary of experimental data indicates that the accuracy is comparable for actual data.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Ultramicroscopy - Volume 155, August 2015, Pages 20-26
نویسندگان
, , ,