کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
8050789 1519360 2017 6 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Predicción de solubilidad de fármacos usando máquinas de soporte vectorial sobre unidades de procesamiento gráfico
ترجمه فارسی عنوان
پیش بینی محلول بودن داروها با استفاده از دستگاه های پشتیبانی بردار در واحد پردازش.
کلمات کلیدی
ماشین پشتیبانی بردار، واحد پردازش گرافیکی، بیوانفورماتیک، زیست شناسی محاسباتی، پشتیبانی از ماشین های بردار واحد پردازش گرافیکی، بیوانفورماتیک، زیست شناسی محاسباتی،
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه سایر رشته های مهندسی مکانیک محاسباتی
چکیده انگلیسی
In this work we discuss the benefits of using computational intelligence methods, like Support Vector Machines (SVM) for the optimization of the prediction of compounds solubility. SVMs are trained with a database of known soluble and insoluble compounds, and this information is being exploited afterwards to improve Virtual Screening (VS) prediction. The landscape in the high performance computing arena opens up great opportunities in the simulation of relevant biological systems and for applications in bioinformatics, computational biology and computational chemistry. Larger databases increase the chances of generating hits or leads, but the computational time needed for the calculations increases not only with the size of the database but also with the accuracy of the VS methods and the model. We discussed the benefits of using massively parallel architectures, in particular graphics processing units. We empirically demonstrate that GPUs are well-suited architecture for the acceleration of SVM, obtaining up to 15 times sustained speedup compared to its sequential counterpart version.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Revista Internacional de Métodos Numéricos para Cálculo y Diseño en Ingeniería - Volume 33, Issues 1–2, January–June 2017, Pages 97-102
نویسندگان
, , , , , , ,