Ecology of the forest microbiome: Highlights of temperate and boreal ecosystems

با توجه به تاریخچه استفاده از زمین، اکثر جنگل های معتدل و غربی در حال حاضر بر روی خاک های مضر فقیر و سنگی، حفظ خاک های حاصلخیز برای کشاورزی توسعه یافته است. در نتیجه، شرایطی که در اکوسیستم های جنگلی بوجود می آیند بسیار متفاوت از سایر محیط های زمینی است و اهمیت دسترسی به عناصر غذایی و بازیافت آنها را برای توسعه طولانی مدت اکوسیستم های جنگلی به ارمغان می آورد. در این بررسی، ما خلاصه ای از یافته های اخیر در ارتباط بین جوامع باکتری و قارچی و میزبان درختان در هر دو سطح تاکسونومیک و عملکردی ارائه می کنیم. ما برجسته های متداول و متنوعی از این جوامع میکروبی را برجسته کردیم، با تمرکز بر تاثیر گونه های درختی، رابط های مختلف بین درختان و محیط آنها، تاثیر محصولات زراعی درخت (چوب و بستر فرسوده)، تاثیر خاک و تغییرات فصلی، و در نهایت، پیامدهای اقدامات جنگلداری. با ارائه هر گونه تنوع طبقه بندی و عملکردی بر اساس تجزیه و تحلیل وابسته به کشت و مستقل، ما الگوهای توزیع و صفات کاربردی مشخصه جوامع باکتری و قارچی را مشخص می کنیم. ما همچنین در مورد اهمیت پیوند میکروب شناسی محیطی به ژنومیک و نحوه ادغام تعامل بین میکروارگانیسم ها برای درک بهتر رشد و سلامت درخت بحث می کنیم.