Integrative taxonomy of ciliates: Assessment of molecular phylogenetic content and morphological homology testing

مورفولوژی بسیار متنوع و نسبتا پیچیده ای از تبهکاران، به مفاهیم بسیاری از اصطلاحات تاکسونومی منجر شده است. با این حال، محتوای اطلاعاتی نشانگرهای مولکولی مورد استفاده، به ندرت پیش از تجزیه و تحلیل های فیلوژنتیک و تصمیم گیری های طبقه بندی شده مورد بررسی قرار گرفته است. به همین ترتیب، تست قوی از اظهارات هماهنگی مورفولوژیکی و ماهیت آپومورفیک از ویژگی های تشخیصی تاکسی های پوستی به ندرت انجام می شود. چهار تکنیک فیلوژنتیک که ممکن است به حل این مسائل کمک کند بررسی می شوند. (1) تجزیه و تحلیل طیف تقسیم شده به منظور تعیین تعداد دقیق و کیفیت مکان های نوکلئوتیدی پشتیبانی گره های فردی در درختان فیلوژنتیکی و تشخیص مصنوعات طولانی شاخه ای که باعث فیزیولوژیک های جعلی می شود. (2) تجزیه و تحلیل شبکه می تواند تمام مسیرهای تکاملی ممکن را که از مجموعه داده ها قابل استخراج است، نشان دهد و درگیری بین آنها را تعیین و اندازه گیری کند. (3) نقشه برداری احتمالی پیشین مناسب بودن داده ها را برای بازسازی یک درخت به خوبی حل می کند، تصویری از درخت کوارتت ها را نشان می دهد و حمایت از شاخه داخلی یک توپولوژی درخت را ارزیابی می کند. (4) بازسازی مورفولوژی اجداد می تواند برای تجزیه و تحلیل همولیست ها و بیانات آپومورفی بدون استدلال دایره ای استفاده شود. از آنجا که این ابزار فیلوژنتیک به ندرت مورد استفاده قرار می گیرند، اصول و تفسیر آنها معرفی می شوند و با استفاده از گروه های مختلف سیلاب ها نمونه می شوند. در نهایت، داده های توالی زیست محیطی در این نور مورد بحث قرار می گیرند.