کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
8384610 | 1543650 | 2015 | 5 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Prospects and challenges for fungal metatranscriptomics of complex communities
ترجمه فارسی عنوان
چشم انداز و چالش های متاتارس قارچی جوامع پیچیده
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
علوم کشاورزی و بیولوژیک
بوم شناسی، تکامل، رفتار و سامانه شناسی
چکیده انگلیسی
The ability to extract and purify messenger RNA directly from plants, decomposing organic matter and soil, followed by high-throughput sequencing of the pool of expressed genes, has spawned the emerging research area of metatranscriptomics. Each metatranscriptome provides a snapshot of the composition and relative abundance of actively transcribed genes, and thus provides an assessment of the interactions between soil microorganisms and plants, and collective microbial metabolic processes in many environments. We highlight current approaches for analysis of fungal transcriptome and metatranscriptome datasets across a gradient of community complexity, and note benefits and pitfalls associated with those approaches. We discuss knowledge gaps that limit our current ability to interpret metatranscriptome datasets and suggest future research directions that will require concerted efforts within the scientific community.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Fungal Ecology - Volume 14, April 2015, Pages 133-137
Journal: Fungal Ecology - Volume 14, April 2015, Pages 133-137
نویسندگان
Cheryl R. Kuske, Cedar N. Hesse, Jean F. Challacombe, Daniel Cullen, Joshua R. Herr, Rebecca C. Mueller, Adrian Tsang, Rytas Vilgalys,