Analysis of network motifs in cellular regulation: Structural similarities, input-output relations and signal integration

بخش بزرگی از پیچیدگی شبکه های نظارتی از ضرورت ادغام سیگنال های متعدد و جلوگیری از سوء عملکرد به علت اختلافات متقابل و مضر حاصل می شود. از این رو ممکن است انتظار داشته باشید که رفتار ورودی-خروجی شبکه های بزرگتر لزوما پیچیده تر از مضامین شبکه های کوچکتر باشد که نشان می دهد که هر دو تحت شرایط خاص می توانند با معادلات مشابه شرح داده شوند. در این بررسی، ما این رویکرد را با بحث درباره شباهت هایی که در توصیف حالت پایدار واکنش های ساده دوقطبی، چرخه های اصلاح کوانتومی و سیستم های دو جزء باکتری وجود دارد، نشان می دهیم. جالب توجه است که در هر سه سیستم، ویژگی های ورودی و خروجی اساسی مانند آستانه، حساسیت فوق حساسیت یا قدرت تمرکز با معادلات ساختاری مشابه می باشد. بسته به سیستم، معنی پارامترها می تواند از غلظت پروتئین و ثابت های وابستگی به ترکیبات پارامترهای پیچیده متفاوت باشد که اجازه می دهد تا در درک کمی از ادغام سیگنال در این سیستم ها. ما استدلال می کنیم که این رویکرد همچنین می تواند به شبکه های نظارتی بزرگ تر گسترش یابد.