کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
8480266 | 1551375 | 2015 | 12 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
How computational models can help unlock biological systems
ترجمه فارسی عنوان
چگونه مدل های محاسباتی می توانند به باز کردن سیستم های بیولوژیکی کمک کنند
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
ترجمه چکیده
با استفاده از مدلهای محاسباتی که در رشد علم نقش مهمی را در پیش می گیرند مهم است که محققان درک کنند منظور چیست؟ تشخیص مفاهیم مراحل مفهومی، ریاضی و الگوریتمیک ساخت مدل؛ و درک آنچه که می تواند و نمی تواند انجام دهد. در اینجا، از نمونه هایی استفاده می کنیم که نشان می دهد که مدل ها می توانند نقش های متنوعی را دربر داشته باشند، از جمله تست فرضیه ها، ایجاد بینش جدید، درک عمیق تر، پیشنهادات و تفسیر آزمایش ها، ردیابی زنجیره های علیت، انجام تحلیل های حساسیت، ادغام دانش و الهام گرفتن از رویکردهای جدید. ما نشان می دهیم که مدل ها می توانند اطلاعات مختلفی را جمع آوری کنند و این کار را در طیف وسیعی از مقیاس های طول انجام می دهند، همانطور که در مدل های چند بعدی، جنبش های چند گانه ای که برخی از آنها بیانگر ژن، سی تی اسکن، خواص سلولی، مکانیک بافت ، حرکات مورفوژنیک و فنوتیپ ها. مدلها نمیتوانند آزمایشات را جایگزین کنند و نمیتوانند ثابت کنند که مکانیزمهای خاص در یک موقعیت خاص کار می کنند. اما آنها می توانند نشان دهند که یک مکانیسم پیشنهادی کافی برای تولید یک پدیده مشاهده شده است یا خیر. اگر چه نمونه های این مقاله به طور عمده از زمینه مکانیک جنین گرفته شده است، بیشتر بحث ها و بحث ها در هر نوع مدل سازی محاسباتی قابل استفاده است.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
بیولوژی سلول
چکیده انگلیسی
With computation models playing an ever increasing role in the advancement of science, it is important that researchers understand what it means to model something; recognize the implications of the conceptual, mathematical and algorithmic steps of model construction; and comprehend what models can and cannot do. Here, we use examples to show that models can serve a wide variety of roles, including hypothesis testing, generating new insights, deepening understanding, suggesting and interpreting experiments, tracing chains of causation, doing sensitivity analyses, integrating knowledge, and inspiring new approaches. We show that models can bring together information of different kinds and do so across a range of length scales, as they do in multi-scale, multi-faceted embryogenesis models, some of which connect gene expression, the cytoskeleton, cell properties, tissue mechanics, morphogenetic movements and phenotypes. Models cannot replace experiments nor can they prove that particular mechanisms are at work in a given situation. But they can demonstrate whether or not a proposed mechanism is sufficient to produce an observed phenomenon. Although the examples in this article are taken primarily from the field of embryo mechanics, most of the arguments and discussion are applicable to any form of computational modelling.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Seminars in Cell & Developmental Biology - Volumes 47â48, December 2015, Pages 62-73
Journal: Seminars in Cell & Developmental Biology - Volumes 47â48, December 2015, Pages 62-73
نویسندگان
G. Wayne Brodland,