How computational models can help unlock biological systems

با استفاده از مدلهای محاسباتی که در رشد علم نقش مهمی را در پیش می گیرند مهم است که محققان درک کنند منظور چیست؟ تشخیص مفاهیم مراحل مفهومی، ریاضی و الگوریتمیک ساخت مدل؛ و درک آنچه که می تواند و نمی تواند انجام دهد. در اینجا، از نمونه هایی استفاده می کنیم که نشان می دهد که مدل ها می توانند نقش های متنوعی را دربر داشته باشند، از جمله تست فرضیه ها، ایجاد بینش جدید، درک عمیق تر، پیشنهادات و تفسیر آزمایش ها، ردیابی زنجیره های علیت، انجام تحلیل های حساسیت، ادغام دانش و الهام گرفتن از رویکردهای جدید. ما نشان می دهیم که مدل ها می توانند اطلاعات مختلفی را جمع آوری کنند و این کار را در طیف وسیعی از مقیاس های طول انجام می دهند، همانطور که در مدل های چند بعدی، جنبش های چند گانه ای که برخی از آنها بیانگر ژن، سی تی اسکن، خواص سلولی، مکانیک بافت ، حرکات مورفوژنیک و فنوتیپ ها. مدلها نمیتوانند آزمایشات را جایگزین کنند و نمیتوانند ثابت کنند که مکانیزمهای خاص در یک موقعیت خاص کار می کنند. اما آنها می توانند نشان دهند که یک مکانیسم پیشنهادی کافی برای تولید یک پدیده مشاهده شده است یا خیر. اگر چه نمونه های این مقاله به طور عمده از زمینه مکانیک جنین گرفته شده است، بیشتر بحث ها و بحث ها در هر نوع مدل سازی محاسباتی قابل استفاده است.