کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
8876480 1623755 2018 33 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
The role of stochastic sequestration dynamics for intrinsic noise filtering in signaling network motifs
ترجمه فارسی عنوان
نقش پویایی تخصیص تصادفی برای فیلتر کردن نویز ذاتی در نقاط شبکۀ
کلمات کلیدی
یکپارچه سازی، آبشار سیگنالینگ، مدل سازی تصادفی، توزیع دینامیک،
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری علوم کشاورزی و بیولوژیک علوم کشاورزی و بیولوژیک (عمومی)
چکیده انگلیسی
The relation between design principles of signaling network motifs and their robustness against intrinsic noise still remains illusive. In this work we investigate the role of cascading for coping with intrinsic noise due to stochasticity in molecular reactions. We use stochastic approaches to quantify fluctuations in the terminal kinase of phosphorylation-dephosphorylation cascade motifs and demonstrate that cascading highly affects these fluctuations. We show that this purely stochastic effect can be explained by time-varying sequestration of upstream kinase molecules. In particular, we discuss conditions on time scales and parameter regimes which lead to a reduction of output fluctuations. Our results are put into biological context by adapting rate parameters of our modeling approach to biologically feasible ranges for general binding-unbinding and phosphorylation-dephosphorylation mechanisms. Overall, this study reveals a novel role of stochastic sequestration for dynamic noise filtering in signaling cascade motifs.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Theoretical Biology - Volume 455, 14 October 2018, Pages 86-96
نویسندگان
, ,