کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
8876902 1623773 2018 7 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Evaluating genetic drift in time-series evolutionary analysis
ترجمه فارسی عنوان
ارزیابی ریسک ژنتیکی در تجزیه و تحلیل تکاملی سری
کلمات کلیدی
راندگی ژنتیکی، داده های توالی ژنوم زمان حل، رایت مدل فیشر، تکامل تجربی،
ترجمه چکیده
مدل رایت فیشر محبوب ترین مدل جمعیت برای توصیف رفتار سیستم های تکاملی با یک اندازه جمعیت محدود است. تقریبها معمولا مورد استفاده قرار می گیرند، اما این مدل به ندرت بر روی داده های ژنومی حل شده با زمان آزمایش شده است. در اینجا، ما اندازه گیری می کنیم که می توان آن را به عنوان مدل درست در زیر چارچوب احتمالی فرض کرد. با توجه به داده های گسترده ی ژنوم از یک آزمایش تکاملی، مدل رشت رایت-فیشر را به عنوان گزینه ی بهتر برای توصیف مسیرهای تکاملی در یک جمعیت محدود، معتبر می کنیم. این کار با ارزیابی عملکرد آن در برابر یک مدل گاوسی از انتشار فرکانس آلل یافت شد. با این حال، ما تعدادی از شرایط را تحت عنوان تحت عنوان استاندارد رایت رایت فیش را نمی توان به درستی مشخص کرد.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری علوم کشاورزی و بیولوژیک علوم کشاورزی و بیولوژیک (عمومی)
چکیده انگلیسی
The Wright-Fisher model is the most popular population model for describing the behaviour of evolutionary systems with a finite population size. Approximations have commonly been used but the model itself has rarely been tested against time-resolved genomic data. Here, we evaluate the extent to which it can be inferred as the correct model under a likelihood framework. Given genome-wide data from an evolutionary experiment, we validate the Wright-Fisher drift model as the better option for describing evolutionary trajectories in a finite population. This was found by evaluating its performance against a Gaussian model of allele frequency propagation. However, we note a range of circumstances under which standard Wright-Fisher drift cannot be correctly identified.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Theoretical Biology - Volume 437, 21 January 2018, Pages 51-57
نویسندگان
, , ,