کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
8918028 1642813 2018 29 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Machine learning and image-based profiling in drug discovery
ترجمه فارسی عنوان
یادگیری ماشین و پروفایل مبتنی بر تصویر در کشف مواد مخدر
کلمات کلیدی
ترجمه چکیده
افزایش کارایی تصویربرداری، چارچوب تحلیلی جدید و منابع محاسباتی با کارایی بالا، فرصت های جدیدی برای شناسایی فنوتیپ های غنی از اطلاعات مولکول های کوچک در کشف مواد مخدر را باز می کند. برای تشخیص مکانیزم های عمل، اثربخشی هدف و سمیت مولکول های کوچک، برای ارزیابی فنوتیپ های تک سلولی براساس روش های تصویر برداری مبتنی بر تصویر استفاده شده است. پیشرفت های تکنولوژیکی برای تولید مجموعه داده های بزرگ همراه با روش های جدید یادگیری ماشین برای تجزیه و تحلیل داده های پروفایل یابی با ابعاد، فرصت هایی را برای بهبود بسیاری از مراحل کشف مواد مخدر فراهم می کند. در این بررسی، ما بحث خواهیم کرد که چگونه مطالعات اخیر روش های یادگیری ماشین را در جریان کارکرد پروفایل های کاربردی با تمرکز بر روی ژنتیک شیمیایی، مورد استفاده قرار داد. در حالیکه ابزارهایشان در غربالگری و پروفایل سازی مبتنی بر تصویر قابل پیش بینی است، نمونه هایی از بینش های جدید فراتر از وضعیت موجود بر اساس کاربردهای روش های یادگیری ماشین شروع به ظهور می کنند. برای فعال کردن اکتشافات، مطالعات آینده همچنین نیاز به توسعه روش هایی دارند که مانع ورود به آزمایش های پروفیل پیشرفته را با بهینه سازی تست های پروفایل مبتنی بر تصویر و ارائه برنامه های کاربردی برای فن آوری های پیشرفته یادگیری مانند آسان ساختن شبکه های عصبی عمیق، کاهش می دهد.
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه مهندسی کامپیوتر علوم کامپیوتر (عمومی)
چکیده انگلیسی
The increase in imaging throughput, new analytical frameworks and high-performance computational resources open new avenues for data-rich phenotypic profiling of small molecules in drug discovery. Image-based profiling assays assessing single-cell phenotypes have been used to explore mechanisms of action, target efficacy and toxicity of small molecules. Technological advances to generate large data sets together with new machine learning approaches for the analysis of high-dimensional profiling data create opportunities to improve many steps in drug discovery. In this review, we will discuss how recent studies applied machine learning approaches in functional profiling workflows with a focus on chemical genetics. While their utility in image-based screening and profiling is predictably evident, examples of novel insights beyond the status quo based on the applications of machine learning approaches are just beginning to emerge. To enable discoveries, future studies also need to develop methodologies that lower the entry barriers to high-throughput profiling experiments by streamlining image-based profiling assays and providing applications for advanced learning technologies such as easy to deploy deep neural networks.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Current Opinion in Systems Biology - Volume 10, August 2018, Pages 43-52
نویسندگان
, , ,