Model microbial communities for ecosystems biology

با وجود همه جا جوامع میکروبی و اهمیت اکولوژیکی و پزشکی آنها، تعاملات بین گونه ای که این جوامع را با هم ادغام می کنند و پویایی آنها را مدیریت می کنند، هنوز تا حد زیادی ناشناخته است. تحولات اخیر در فن آوری های با توان بالا و مدل سازی محاسباتی، چالش کشف توازن پیچیده بین گونه ها را در دسترس می گذارد. با این حال، اندازه بسیاری از جوامع میکروبی که در اکوسیستم های طبیعی زندگی می کنند، اغلب برای حل و فصل بسیار زیاد است، چشم انداز تعامل بسیار پیچیده است و جوامع برای دستکاری آن دشوار است. جوامع مختلف مدل برای غلبه بر این چالش پیشنهاد شده است، هر کدام برای مجموعه ای خاص از سوالات تحقیقاتی مناسب هستند. اندازه آنها از چند تا گونه به مجموعه های بزرگ که دارای چند صد اعضای آن می باشد، متغیر است. در حالی که جوامع کوچکتر مصنوعی را می توان تحت شرایط بسیار کنترل شده مورد مطالعه قرار داد، طبقات پیچیده طبیعی بهتر از وضعیت اکولوژیکی منعکس می شوند. در اینجا، ما یک مرور کلی از جوامع مختلف مدل ارائه می دهیم و پنج ویژگی کلیدی را برای ارزیابی مناسب بودن آنها برای سوالات مختلف تحقیق ارائه می دهیم: نمایندگی، ثبات، کاهش اندازه، قابلیت دسترسی و قابلیت اطمینان.