کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
8918108 | 1642818 | 2017 | 10 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Learning regulatory models for cell development from single cell transcriptomic data
ترجمه فارسی عنوان
مدلهای نظارتی برای توسعه سلول از داده های تک سلولی تک سلولی
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
ترجمه چکیده
اطلاعات تک سلولی سلول های تک سلولی اجازه می دهد تا ما را بررسی تغییرات رونویسی رخ می دهد در طول توسعه سلول در جزئیات بی سابقه ای. این مجموعه داده های پیچیده در حال توسعه ابزارهای محاسباتی و آماری جدید هستند که انقلابی در درک ما از فرایندهای تمایز است. بسیاری از روشهای خوشه بندی و ابعاد بعدی برای کمک به تجسم و اکتشاف ساختار در این مجموعه داده ها وجود دارد. به طور مرتب، الگوریتم های مرتبه شبه مرتبه و استنتاج شبکه، در حال ظهور هستند که هدف آنها کشف مکانیزم های کنترل کننده ای است که باعث تغییر و تحول در حالت بیان ژن می شود. ترکیب چندین روش تحلیلی ما را قادر می سازد تا بهترین استفاده از اطلاعات مکمل ای که آنها ارائه می دهند را به بهترین نحو ممکن بکار گیریم و جزئیات لازم برای به دست آوردن مدل های ریاضی توصیف ساختار و پویایی شبکه های نظارتی ژن را فراهم می آورد.
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه
مهندسی کامپیوتر
علوم کامپیوتر (عمومی)
چکیده انگلیسی
Single cell transcriptomic data allow us to probe the transcriptional changes occurring during cell development in unprecedented detail. These complex datasets are driving the development of new computational and statistical tools that are revolutionizing our understanding of differentiation processes. Many clustering and dimensionality reduction methods exist to aid visualization and exploration of structure in these datasets. Increasingly, pseudotemporal ordering and network inference algorithms are emerging that aim to elucidate the regulatory mechanisms that drive and control changes in gene expression state. Combining multiple analytical approaches enables us to make best use of the complementary information they offer, and provides the detail needed to infer mathematical models describing the structure and dynamics of gene regulatory networks.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Current Opinion in Systems Biology - Volume 5, October 2017, Pages 72-81
Journal: Current Opinion in Systems Biology - Volume 5, October 2017, Pages 72-81
نویسندگان
Ann C. Babtie, Thalia E. Chan, Michael P.H. Stumpf,