Nucleotide sequence of the matrix protein gene of avian paramyxovirus, serotype 3b: evidence on another member of the suggested new genus of the subfamily Paramyxovirinae

La séquence nucléotidique complète du gène codant pour la protéine de la matrice d'un paramyxovirus aviaire, sérotype 3b (APMV-3b) a été déterminée par séquençage direct de l'ARN viral a l'aide d'une réaction 'reverse transcriptase'. Les régions adjacentes des gènes de la phosphoprotéine (P) et de la protéine de fusion (F) ont aussi été séquençée afin de déterminer la séquence consensuelle du génome viral, de la zone poly(A), des régions non codantes en amont et en aval des gènes P et F respectivement, ainsi que les régions correspondantes entre ces différents gènes. Le gène est constitué de 1478 nucléotides dont une région codante de 1194 nucléotides. La protéine déduite est formée de 398 amino acides et à un poids moléculaire estimé de 44,465. Selon l'alignement multiple et l'analyse de l'arbre phylogénétique, la protéine M de l'APMV-3b montre la plus grande proximité avec le virus de la maladie de Newcastle (NDV) qui a été récemment proposé pour être transféré du genre Rubulavirus au nouveau genre Avulavirus (avec APMV-6) au sein de la sous-famille Paramyxovirinae de la famille Paramyxoviridae. Basée sur l'alignement multiple, l'arbre phylogénétique, l'identification du signal de localisation nucléaire 'bipartite' en combinaison avec la distribution de résidus cystéine et le degrée d'hétérogénéité interne au genre, le APMV-3b est donc proposé comme autre membre du nouveau genre (avec NDV et APMV-6).