کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
9127013 | 1160193 | 2005 | 7 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
A genome-wide screening of BEL-Pao like retrotransposons in Anopheles gambiae by the LTR_STRUC program
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
ORFPBSRNase HLTRintAnopheles gambiaeENVTSDReverse transcriptase - ترانس کریپتاز معکوس یا وارونویسTarget site duplication - تکثیر سایت هدفLong terminal repeat - تکرار طولانی مدتRibonuclease H - ریبونوکلئاز HPrimer binding site - سایت پیوند اولیهTransposable elements - عناصر قابل حملPhylogeny - فیلوژنیopen reading frame - قاب خواندن بازMultiple alignment - هماهنگی چندگانهEnvelope - پاکت نامهprotease domain - پروتئاز دامنه
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
ژنتیک
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
The advanced status of assembly of the nematoceran Anopheles gambiae genomic sequence allowed us to perform a wide genome analysis to looking at the presence of Long Terminal Repeats (LTRs) in the range of 10 kb by means of the LTR_STRUC tool. More than three hundred sequences were retrieved and 210 were treated as putative complete retrotransposons that were individually analysed with respect to known retrotransposons of A. gambiae and D. melanogaster. The results show that the vast majority of the retrotransposons analysed belong to the Ty3/gypsy class and only 8% to the Ty1/copia class. In addition, phylogenetic analysis allowed us to characterize in more detail the relationship of a large BEL-Pao lineage in which a single family was shown to harbour an additional env gene.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Gene - Volume 357, Issue 2, 12 September 2005, Pages 115-121
Journal: Gene - Volume 357, Issue 2, 12 September 2005, Pages 115-121
نویسندگان
Renè Massimiliano Marsano, Ruggiero Caizzi,